Basic Information

Symbol
AURKB
RNA class
mRNA
Alias
Aurora Kinase B AIM-1 ARK2 STK5 PPP1R48 STK12 Aik2 IPL1 AurB Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 48 Serine/Threonine-Protein Kinase Aurora-B Serine/Threonine-Protein Kinase 12 Serine/Threonine-Protein Kinase 5 Aurora/IPL1-Related Kinase 2 Serine/Threonine Kinase 12 Aurora-Related Kinase 2 EC 2.7.11.1 Aurora-B Aurora-1 ARK-2 STK-1 AIM1 Aurora- And Ipl1-Like Midbody-Associated Protein 1 Homolog (Rat) Aurora- And Ipl1-Like Midbody-Associated Protein 1 Homolog Aurora- And Ipl1-Like Midbody-Associated Protein 1 Aurora- And IPL1-Like Midbody-Associated Protein 1 Aurora Kinase B-Sv1 Aurora Kinase B-Sv2 Aurkb-Sv1 Aurkb-Sv2 EC 2.7.11 Aurora 1 AIRK2 AIK2 STK1
Location (GRCh38)
17:8204335-8210634
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004217.4
Sequence length
1243.0 nt
GC content
0.5567

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-444.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -466.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 229.10
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001256834.3 NCBI
AGUUGUUUGCGGGCGGCCGGGAGAGUAGCAGUGCCUUGGACCCCAGGCU… 1170 nt 0.5530
NM_001284526.2 NCBI
AGUUGUUUGCGGGCGGCCGGGAGAGUAGCAGUGCCUUGGACCCCAGCUC… 1246 nt 0.5570
NM_001313950.2 NCBI
AGUUGUUUGCGGGCGGCCGGGAGAGUAGCAGUGCCUUGGACCCCAGGAU… 1219 nt 0.5570
NM_001313951.1 NCBI
CUCUCCUCCCCCUUUCUCUCUAAGGAUGGCCCAGAAGGAGAACUCCUAC… 1319 nt 0.5459
NM_001313952.2 NCBI
AGUUGUUUGCGGGCGGCCGGGAGAGUAGCAGUGCCUUGGACCCCAGCAC… 1234 nt 0.5551
NM_001313953.3 NCBI
AGUUGUUUGCGGGCGGCCGGGAGAGUAGCAGUGCCUUGGACCCCAGCUC… 1147 nt 0.5588
NM_001313954.2 NCBI
AGUUGUUUGCGGGCGGCCGGGAGAGUAGCAGUGCCUUGGACCCCAGCUC… 1253 nt 0.5595
NM_001313955.2 NCBI
AGUUGUUUGCGGGCGGCCGGGAGAGUAGCAGUGCCUUGGACCCCAGGCU… 889 nt 0.5579
NM_004217.4 NCBI
AGUUGUUUGCGGGCGGCCGGGAGAGUAGCAGUGCCUUGGACCCCAGCUC… 1243 nt 0.5567
Summary

This gene encodes a member of the aurora kinase subfamily of serine/threonine kinases. The genes encoding the other two members of this subfamily are located on chromosomes 19 and 20. These kinases participate in the regulation of alignment and segregation of chromosomes during mitosis and meiosis through association with microtubules. A pseudogene of this gene is located on chromosome 8. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2015] CIViC Summary for AURKB Gene

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the AURKB mRNA showed suggestively higher expression in platelets from patients with ST-segment elevation myocardial infarction (STEMI) compared to those with non-STEMI (NSTEMI) [Eicher et al. DOI:10.3109/09537104.2015.1083543].