Basic Information

Symbol
ACAT2
RNA class
mRNA
Alias
Acetyl-CoA Acetyltransferase 2 Acetyl-CoA Acetyltransferase, Cytosolic Acetyl-CoA Transferase-Like Protein Cytosolic Acetoacetyl-CoA Thiolase Acetoacetyl Coenzyme A Thiolase EC 2.3.1.9 Acetyl-Coenzyme A Acetyltransferase 2 (Acetoacetyl Coenzyme A Thiolase) Acetyl-Coenzyme A Acetyltransferase 2 EC 2.3.1 ACTL
Location (GRCh38)
6:159761981-159779821
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005891.3
Sequence length
1520.0 nt
GC content
0.4553

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-473.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -502.73 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 349.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001303253.1 NCBI
GGUAAUGCCUGCGGCAGGGGCGGAACUGCUAGGUGGUCUGAGCCCGGCU… 1723 nt 0.4724
NM_005891.3 NCBI
AGCUUGCAGGCAGCGCAGGGCAGACGGCGGCAGGAGAAGCAAGAUGAAU… 1520 nt 0.4553
Summary

The product of this gene is an enzyme involved in lipid metabolism, and it encodes cytosolic acetoacetyl-CoA thiolase. This gene shows complementary overlapping with the 3-prime region of the TCP1 gene in both mouse and human. These genes are encoded on opposite strands of DNA, as well as in opposite transcriptional orientation. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2014]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ACAT2 mRNA is downregulated in an alcoholic liver disease model and its expression is reduced upon depletion of the associated lncRNA lnc_1700023H06Rik in hepatocytes, correlating with induced triglyceride accumulation and lactate dehydrogenase leakage [Dou et al. DOI:10.3389/Fphar.2021.709287]. A study in mice demonstrated that alcohol-induced alcoholic liver disease significantly up-regulated the ACAT2 gene expression, and intervention with Gentiana dahurica Fisch ethanol extract down-regulated it to normal levels [Cao et al. DOI:10.1016/J.Jep.2020.113422].