Basic Information

Symbol
BAG6
RNA class
mRNA
Alias
BAG Cochaperone 6 G3 D6S52E Scythe BAT3 BAG Family Molecular Chaperone Regulator 6 Large Proline-Rich Protein BAG6 HLA-B-Associated Transcript 3 BCL2 Associated Athanogene 6 Protein Scythe Protein G3 BAG-6 Large Proline-Rich Protein BAT3 HLA-B Associated Transcript 3 BCL2-Associated Athanogene 6
Location (GRCh38)
6:31638544-31652747
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001387994.1
Sequence length
3843.0 nt
GC content
0.6008

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1559.52 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1623.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1242.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001387984.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3720 nt 0.5978
NM_001387985.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3723 nt 0.5982
NM_001387986.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3731 nt 0.5985
NM_001387987.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3732 nt 0.5986
NM_001387988.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3751 nt 0.6009
NM_001387989.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3754 nt 0.6010
NM_001387990.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3756 nt 0.5988
NM_001387991.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3789 nt 0.6017
NM_001387992.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3813 nt 0.6019
NM_001387993.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3840 nt 0.6008
Showing 21 to 30 of 59 entries
Summary

This gene was first characterized as part of a cluster of genes located within the human major histocompatibility complex class III region. This gene encodes a nuclear protein that is cleaved by caspase 3 and is implicated in the control of apoptosis. In addition, the protein forms a complex with E1A binding protein p300 and is required for the acetylation of p53 in response to DNA damage. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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