Basic Information

Symbol
BAG6
RNA class
mRNA
Alias
BAG Cochaperone 6 G3 D6S52E Scythe BAT3 BAG Family Molecular Chaperone Regulator 6 Large Proline-Rich Protein BAG6 HLA-B-Associated Transcript 3 BCL2 Associated Athanogene 6 Protein Scythe Protein G3 BAG-6 Large Proline-Rich Protein BAT3 HLA-B Associated Transcript 3 BCL2-Associated Athanogene 6
Location (GRCh38)
6:31638544-31652747
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001387994.1
Sequence length
3843.0 nt
GC content
0.6008

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1559.52 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1623.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1242.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001387994.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3843 nt 0.6008
NM_001387995.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3864 nt 0.6009
NM_001387996.1 NCBI
GCACGCAGGCGUAGUACGGUCCCCCGGGCGACAGCGGUGGCGGCUCCUC… 3867 nt 0.6010
NM_001387997.1 NCBI
GAAGUCGGGGGCGGAGCCGCGGGGUGGUGGGUGUGUGUGUGUGUGUGUG… 3440 nt 0.5924
NM_001387998.1 NCBI
GAAGUCGGGGGCGGAGCCGCGGGGUGGUGGGUGUGUGUGUGUGUGUGUG… 3491 nt 0.5915
NM_001387999.1 NCBI
GAAGUCGGGGGCGGAGCCGCGGGGUGGUGGGUGUGUGUGUGUGUGUGUG… 3494 nt 0.5916
NM_001388000.1 NCBI
GAAGUCGGGGGCGGAGCCGCGGGGUGGUGGGUGUGUGUGUGUGUGUGUG… 3494 nt 0.5936
NM_001388001.1 NCBI
GAAGUCGGGGGCGGAGCCGCGGGGUGGUGGGUGUGUGUGUGUGUGUGUG… 3506 nt 0.5921
NM_001388002.1 NCBI
GAAGUCGGGGGCGGAGCCGCGGGGUGGUGGGUGUGUGUGUGUGUGUGUG… 3560 nt 0.5938
NM_001388003.1 NCBI
GAAGUCGGGGGCGGAGCCGCGGGGUGGUGGGUGUGUGUGUGUGUGUGUG… 3563 nt 0.5939
Showing 31 to 40 of 59 entries
Summary

This gene was first characterized as part of a cluster of genes located within the human major histocompatibility complex class III region. This gene encodes a nuclear protein that is cleaved by caspase 3 and is implicated in the control of apoptosis. In addition, the protein forms a complex with E1A binding protein p300 and is required for the acetylation of p53 in response to DNA damage. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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