Basic Information

Symbol
ACBD3
RNA class
mRNA
Alias
Acyl-CoA Binding Domain Containing 3 GCP60 PBR- And PKA-Associated Protein 7 GOCAP1 GOLPH1 PAP7 Peripheral Benzodiazepine Receptor-Associated Protein PAP7 Acyl-Coenzyme A Binding Domain Containing 3 Golgi Complex Associated Protein 1, 60kDa Golgi Resident Protein GCP60 Golgi Phosphoprotein 1 Acyl-CoA-Binding Domain-Containing Protein 3 Golgi Complex-Associated Protein 1 PKA (RIalpha)-Associated Protein
Location (GRCh38)
1:226144679-226186762
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022735.4
Sequence length
3584.0 nt
GC content
0.4182

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1009.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1079.56 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 763.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_022735.4 NCBI
AGAGGUCAGCAGGAAGUCGAUACGUGGCUGCCGUCUGUCCCCGCUGAGG… 3584 nt 0.4182
Summary

The Golgi complex plays a key role in the sorting and modification of proteins exported from the endoplasmic reticulum. The protein encoded by this gene is involved in the maintenance of Golgi structure and function through its interaction with the integral membrane protein giantin. It may also be involved in the hormonal regulation of steroid formation. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human menstrual blood-derived mesenchymal stem cells (MenSCs) from women with endometriosis identified the ACBD3 as a protein overexpressed in endometriosis MenSCs compared to controls through integrated transcriptomic and proteomic analysis using RNA-seq and UHPLC-MS/MS [Penariol et al. DOI:10.3390/ijms231911515].