Basic Information

Symbol
BBC3
RNA class
mRNA
Alias
BCL2 Binding Component 3 PUMA JFY1 P53 Up-Regulated Modulator Of Apoptosis P53-Upregulated Modulator Of Apoptosis JFY-1 Bcl-2-Binding Component 3, Isoforms 3/4 Bcl-2-Binding Component 3, Isoforms 1/2 Bcl-2-Binding Component 3
Location (GRCh38)
19:47220822-47233019
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014417.5
Sequence length
1846.0 nt
GC content
0.6966

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-927.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -956.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 345.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001127240.3 NCBI
AGAGCAGGGCAGGAAGUAACAAUGAGAAACUGAAAAAGAAACGGAAUGG… 1728 nt 0.6684
NM_001127241.3 NCBI
AGAGCAGGGCAGGAAGUAACAAUGAGAAACUGAAAAAGAAACGGAAUGG… 1439 nt 0.6372
NM_001127242.3 NCBI
AGAGCAGGGCAGGAAGUAACAAUGAGAAACUGAAAAAGAAACGGAAUGG… 1248 nt 0.6178
NM_014417.5 NCBI
GAGACGCGGCGCGAGCCACAUGCGAGCGGGCGCCUGGCGGCGGCGGCGG… 1846 nt 0.6966
Summary

This gene encodes a member of the BCL-2 family of proteins. This family member belongs to the BH3-only pro-apoptotic subclass. The protein cooperates with direct activator proteins to induce mitochondrial outer membrane permeabilization and apoptosis. It can bind to anti-apoptotic Bcl-2 family members to induce mitochondrial dysfunction and caspase activation. Because of its pro-apoptotic role, this gene is a potential drug target for cancer therapy and for tissue injury. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Dec 2011]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.