Basic Information

Symbol
BCAR1
RNA class
mRNA
Alias
BCAR1 Scaffold Protein, Cas Family Member CASS1 CAS Cas Scaffolding Protein Family Member 1 P130Cas Crkas Breast Cancer Anti-Estrogen Resistance Protein 1 BCAR1, Cas Family Scaffolding Protein BCAR1, Cas Family Scaffold Protein Breast Cancer Anti-Estrogen Resistance 1 Crk-Associated Substrate P130Cas Crk-Associated Substrate CRK-Associated Substrate P130cas CRKAS CAS1
Location (GRCh38)
16:75228181-75268053
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014567.5
Sequence length
4085.0 nt
GC content
0.6546

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1899.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1965.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 824.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001170714.3 NCBI
AUGCGCGGCGCGGCUGGAGCGGCCGGACAGUCCGGCGUCCGGGAACGCU… 4365 nt 0.6509
NM_001170715.3 NCBI
AGACACCUGGUAGUGUCAGGAGAGGGCAUGCACUGCCCUGGUGAGGCUC… 4024 nt 0.6481
NM_001170716.3 NCBI
AGGUCCCCGCCAUGAGCCCGGGCUGCGGCAAACCAGCCUCAUGGAGCUG… 4123 nt 0.6488
NM_001170717.3 NCBI
GGACCGGCUCUGGGUGGCCGAGGCGGCAGCUGCGCGGCGGCACCGGGGC… 4139 nt 0.6545
NM_001170718.3 NCBI
AUGCGCGGCGCGGCUGGAGCGGCCGGACAGUCCGGCGUCCGGGAACGCU… 4114 nt 0.6551
NM_001170719.3 NCBI
GUCUCAGCCUGGGGUCGGCCUCUGCUGCUUCUGGACUCAGUGACCCUGG… 4029 nt 0.6466
NM_001170720.3 NCBI
AUGCGCGGCGCGGCUGGAGCGGCCGGACAGUCCGGCGUCCGGGAACGCU… 3834 nt 0.6502
NM_001170721.3 NCBI
AGCCGGGACUCUGCUACCAGGCGUGCUGGAGACCUAGUGGGCCCAGUUC… 3880 nt 0.6510
NM_014567.5 NCBI
GGACCGGCUCUGGGUGGCCGAGGCGGCAGCUGCGCGGCGGCACCGGGGC… 4085 nt 0.6546
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the Crk-associated substrate (CAS) family of scaffold proteins, characterized by the presence of multiple protein-protein interaction domains and many serine and tyrosine phosphorylation sites. The encoded protein contains a Src-homology 3 (SH3) domain, a proline-rich domain, a substrate domain which contains 15 repeat of the YxxP consensus phosphorylation motif for Src family kinases, a serine-rich domain, and a bipartite Src-binding domain, which can bind both SH2 and SH3 domains. This adaptor protein functions in multiple cellular pathways, including in cell motility, apoptosis and cell cycle control. Dysregulation of this gene can have a wide range of effects, affecting different pathways, including cardiac development, vascular smooth muscle cells, liver and kidney function, endothelial migration, and cancer. [provided by RefSeq, Sep 2017]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the BCAR1 transcript, a gene involved in immune regulation, increased in relative abundance within one hour postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].