Basic Information

Symbol
BECN1
RNA class
mRNA
Alias
Beclin 1 VPS30 ATG6 Coiled-Coil Myosin-Like BCL2-Interacting Protein Beclin 1, Autophagy Related Beclin-1 Beclin 1 (Coiled-Coil, Moesin-Like BCL2 Interacting Protein) Beclin 1 (Coiled-Coil, Moesin-Like BCL2-Interacting Protein) ATG6 Autophagy Related 6 Homolog (S. Cerevisiae) Testis Secretory Sperm-Binding Protein Li 215e ATG6 Autophagy Related 6 Homolog Beclin1-Gamma Protein GT197 Beclin1-Beta Beclin1 GT197
Location (GRCh38)
17:42809870-42833350
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001313998.2
Sequence length
2109.0 nt
GC content
0.4614

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-644.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -683.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 571.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001313998.2 NCBI
CGGCGGCUACCGGGAAGUCGCUGAAGACAGAGCGAUGGUAGUUCUGGAG… 2109 nt 0.4614
NM_001313999.1 NCBI
GGAUGGAAGGGUCUAAGACGUCCAACAACAGCACCAUGCAGGUGAGCUU… 1840 nt 0.4424
NM_001314000.2 NCBI
CGGCGGCUACCGGGAAGUCGCUGAAGACAGAGCGAUGGUAGUUCUGGAG… 1738 nt 0.4528
NM_003766.5 NCBI
CGGCGGCUACCGGGAAGUCGCUGAAGACAGAGCGAUGGUAGUUCUGGAG… 2131 nt 0.4632
Summary

This gene encodes a protein that regulates autophagy, a catabolic process of degradation induced by starvation. The encoded protein is a component of the phosphatidylinositol-3-kinase (PI3K) complex which mediates vesicle-trafficking processes. This protein is thought to play a role in multiple cellular processes, including tumorigenesis, neurodegeneration and apoptosis. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2015]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulates the BECN1 in cortical microglia, where it is involved in autophagy and mitophagy pathways [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].