Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001313999.1

Sequence Length

1840 nt

GC Content

0.4424

GGAUGGAAGGGUCUAAGACGUCCAACAACAGCACCAUGCAGGUGAGCUUCGUGUGCCAGCGCUGCAGCCAGCCCCUGAAACUGGACACGAGUUUCAAGAUCCUGGACCGUGUCACCAUCCAGGAACUCACAGCUCCAUUACUUACCACAGCCCAGGCGAAACCAGGAGAGACCCAGGAGGAAGAGACUAACUCAGGAGAGGAGCCAUUUAUUGAAACUCCUCGCCAGGAUGGUGUCUCUCGCAGAUUCAUCCCCCCAGCCAGGAUGAUGUCCACAGAAAGUGCCAACAGCUUCACUCUGAUUGGGGAGGCAUCUGAUGGCGGCACCAUGGAGAACCUCAGCCGAAGACUGAAGGUCACUGGGGACCUUUUUGACAUCAUGUCGGGCCAGACAGAUGUGGAUCACCCACUCUGUGAGGAAUGCACAGAUACUCUUUUAGACCAGCUGGACACUCAGCUCAACGUCACUGAAAAUGAGUGUCAGAACUACAAACGCUGUUUGGAGAUCUUAGAGCAAAUGAAUGAGGAUGACAGUGAACAGUUACAGAUGGAGCUAAAGGAGCUGGCACUAGAGGAGGAGAGGCUGAUCCAGGAGCUGGAAGACGUGGAAAAGAACCGCAAGAUAGUGGCAGAAAAUCUCGAGAAGGUCCAGGCUGAGGCUGAGAGACUGGAUCAGGAGGAAGCUCAGUAUCAGAGAGAAUACAGUGAAUUUAAACGACAGCAGCUGGAGCUGGAUGAUGAGCUGAAGAGUGUUGAAAACCAGAUGCGUUAUGCCCAGACGCAGCUGGAUAAGCUGAAGAAAACCAACGUCUUUAAUGCAACCUUCCACAUCUGGCACAGUGGACAGUUUGGCACAAUCAAUAACUUCAGGCUGGGUCGCCUGCCCAGUGUUCCCGUGGAAUGGAAUGAGAUUAAUGCUGCUUGGGGCCAGACUGUGUUGCUGCUCCAUGCUCUGGCCAAUAAGAUGGGUCUGAAAUUUCAGAGAUACCGACUUGUUCCUUACGGAAACCAUUCAUAUCUGGAGUCUCUGACAGACAAAUCUAAGGAUGGAUGUGGAGAAAGGCAAGAUUGAAGACACAGGAGGCAGUGGCGGCUCCUAUUCCAUCAAAACCCAGUUUAACUCUGAGGAGCAGUGGACAAAAGCUCUCAAGUUCAUGCUGACGAAUCUUAAGUGGGGUCUUGCUUGGGUGUCCUCACAAUUUUAUAACAAAUGACUUUUUUCCUUAGGGGGAGGUUUGCCUUAAAGGCUUUUAAUUUUGUUUUGUUUGCAAACAUGUUUUAAAUUAAAUUCGGGUAAUAUUAAACAGUACAUGUUUACAAUACCAAAAAAGAAAAAAUCCACAAAAGCCACUUUAUUUUAAAAUAUCAUGUGACAGAUACUUUCCAGAGCUACAACAUGCCAUCUAUAGUUGCCAGCCCUGGUCAGUUUUGAUUCUUAACCCCAUGGACUCCUUUCCCUUUCUUCUCUGAAAAAAACUAAUUUAAAUUUGCUUUUCUUUUUUUUAACUGAGUUGAAUUGAGAUUGAUGUGUUUUCACUGGAUUUUUAUCUCUCUCAACUUCCUGCACUUAACAAUAUGAAAUAGAAACUUUUGUCUUUACUGAGAUGAGGAUAUGUUUGAGAUGCACAGUUGGAUAAUGUGGGAAAAUGACAUCUAAGCUUUACCUGGUCACCAUGUGAUGUGAUCAGAUGCUUGAAAUUUAACACUUUUCACUUGGUUCUUAUACUGAAUGCCGACUCUGCUCUGUGUUAGAGAUAUGAAAUGGUGUUUGAUACUGUUUGAGACAUUAUGGAGAGAUUUAAUUAUUUGUAAUAAAAGAUUUGCUGCAGUCUGAAAACUGCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-527.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -559.98

Frequency: 0.0000

Diversity: 545.00

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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