Basic Information

Symbol
BID
RNA class
mRNA
Alias
BH3 Interacting Domain Death Agonist BH3-Interacting Domain Death Agonist P22 BID Human BID Coding Sequence Apoptic Death Agonist Desmocollin Type 4 FP497
Location (GRCh38)
22:17734138-17774770
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001196.4
Sequence length
2177.0 nt
GC content
0.4805

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-704.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -744.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 476.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001196.4 NCBI
AAGGAGGAAGCGGGUAGUCGACCGUGUCCGCGCGCCUGGGAGACGCUGC… 2177 nt 0.4805
NM_001244567.1 NCBI
CACUGUCUGAAACAGUCGCGUAAGGGGUCGCCACUGGGACACUGUGAAC… 2128 nt 0.4652
NM_001244569.1 NCBI
GAAGGAGGAAGCGCGCGGGGCGCCAUAAGGAGGAAGCGGGUAGUCGACC… 2006 nt 0.4686
NM_001244570.1 NCBI
GAAGGAGGAAGCGCGCGGGGCGCCAUAAGGAGGAAGCGGGUAGUCGACC… 1936 nt 0.4618
NM_001244572.1 NCBI
GAGGGGCCGAGGCCAGCCCCGGAGAGGAGAAAACCCGCGGGCCUGGCCG… 2254 nt 0.4836
NM_197966.3 NCBI
ACCCUUGCCGGCGGAUCGGAAUCCCCGCCCACACCGUGGUCUUUCCAGC… 2462 nt 0.4935
NM_197967.2 NCBI
GAAGGAGGAAGCGCGCGGGGCGCCAUAAGGAGGAAGCGGGUAGUCGACC… 2147 nt 0.4741
Summary

This gene encodes a death agonist that heterodimerizes with either agonist BAX or ant agonist BCL2, and thus regulate apoptosis. The encoded protein is a member of the BCL-2 family of cell death regulators. It is a mediator of mitochondrial damage induced by caspase-8 (CASP8); CASP8 cleaves this encoded protein, and the COOH-terminal part translocates to mitochondria where it triggers cytochrome c release. Multiple alternatively spliced transcript variants have been found. [provided by RefSeq, Aug 2020]

Forensic Context

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