Basic Information

Symbol
ACKR1
RNA class
mRNA
Alias
Atypical Chemokine Receptor 1 (Duffy Blood Group) GPD Atypical Chemokine Receptor 1 Glycoprotein D CCBP1 CD234 DARC Dfy FY Duffy Blood Group, Chemokine Receptor Duffy Antigen Receptor For Chemokines Duffy Blood Group Antigen Plasmodium Vivax Receptor Fy Glycoprotein GpFy Solute Carrier Family 29 Member 1 (Augustine Blood Group) Duffy Blood Group, Atypical Chemokine Receptor Duffy Antigen Chemokine Receptor Duffy Blood Group System Protein Duffy Antigen/Chemokine Receptor Bloodgroup FY Protein Duffy Blood Group CD234 Antigen DARC/ACKR1 WBCQ1
Location (GRCh38)
1:159204568-159206500
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002036.4
Sequence length
1146.0 nt
GC content
0.5750

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-455.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -475.40 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 249.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001122951.3 NCBI
AUUAGUCCUUGGCUCUUAUCUUGGAAGCACAGGCGCUGACAGCCGUCCC… 1196 nt 0.5744
NM_002036.4 NCBI
AUUAGUCCUUGGCUCUUAUCUUGGAAGCACAGGCGCUGACAGCCGUCCC… 1146 nt 0.5750
Summary

The protein encoded by this gene is a glycosylated membrane protein and a non-specific receptor for several chemokines. The encoded protein is the receptor for the human malarial parasites Plasmodium vivax and Plasmodium knowlesi. Polymorphisms in this gene are the basis of the Duffy blood group system. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human corpus cavernosum tissue identified the ACKR1 as a gene marker highly expressed in the EC2 endothelial subcluster [Zhao et al. DOI:10.1038/s41467-022-31950-9].