Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_002036.4

Sequence Length

1146 nt

GC Content

0.5750

AUUAGUCCUUGGCUCUUAUCUUGGAAGCACAGGCGCUGACAGCCGUCCCAGCCCUUCUGUCUGCGGGCCUGAACCAAACGGUGCCAUGGGGAACUGUCUGCACAGGGCGGAGCUCUCCCCCUCAACUGAGAACUCAAGUCAGCUGGACUUCGAAGAUGUAUGGAAUUCUUCCUAUGGUGUGAAUGAUUCCUUCCCAGAUGGAGACUAUGGUGCCAACCUGGAAGCAGCUGCCCCCUGCCACUCCUGUAACCUGCUGGAUGACUCUGCACUGCCCUUCUUCAUCCUCACCAGUGUCCUGGGUAUCCUAGCUAGCAGCACUGUCCUCUUCAUGCUUUUCAGACCUCUCUUCCGCUGGCAGCUCUGCCCUGGCUGGCCUGUCCUGGCACAGCUGGCUGUGGGCAGUGCCCUCUUCAGCAUUGUGGUGCCCGUCUUGGCCCCAGGGCUAGGUAGCACUCGCAGCUCUGCCCUGUGUAGCCUGGGCUACUGUGUCUGGUAUGGCUCAGCCUUUGCCCAGGCUUUGCUGCUAGGGUGCCAUGCCUCCCUGGGCCACAGACUGGGUGCAGGCCAGGUCCCAGGCCUCACCCUGGGGCUCACUGUGGGAAUUUGGGGAGUGGCUGCCCUACUGACACUGCCUGUCACCCUGGCCAGUGGUGCUUCUGGUGGACUCUGCACCCUGAUAUACAGCACGGAGCUGAAGGCUUUGCAGGCCACACACACUGUAGCCUGUCUUGCCAUCUUUGUCUUGUUGCCAUUGGGUUUGUUUGGAGCCAAGGGGCUGAAGAAGGCAUUGGGUAUGGGGCCAGGCCCCUGGAUGAAUAUCCUGUGGGCCUGGUUUAUUUUCUGGUGGCCUCAUGGGGUGGUUCUAGGACUGGAUUUCCUGGUGAGGUCCAAGCUGUUGCUGUUGUCAACAUGUCUGGCCCAGCAGGCUCUGGACCUGCUGCUGAACCUGGCAGAAGCCCUGGCAAUUUUGCACUGUGUGGCUACGCCCCUGCUCCUCGCCCUAUUCUGCCACCAGGCCACCCGCACCCUCUUGCCCUCUCUGCCCCUCCCUGAAGGAUGGUCUUCUCAUCUGGACACCCUUGGAAGCAAAUCCUAGUUCUCUUCCCACCUGUCAACCUGAAUUAAAGUCUACACUGCCUUUGUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-455.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -475.40

Frequency: 0.0000

Diversity: 249.00

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..((((....((((.(((..((((....((((((((.(((((..(........)..))))).)))((((((.......))).)))..(((((....(((((.....)))))....)))))(((....))).....(((((.....))))).(((((.....(((.(((((((...(((((.............((((((((((((((((((....))).((..(((((((((((((.((((..........(((((((.((....(((((((((.............((((....))))........((((((((((.((.......))))))....(((....)))...))))))......(((..((((((((......))).))))))))...)))))))))..)))))))))..((((.((((((((((((((.((((..((((((((((((((((............(((((((((..(((.(((......))).))).....)))))))))..)))))..))))))..))))))))))))))).)))).(((((.(((((........))))))))))..)))))))).)))).)....)))).))))))))))......(((((((.........)).)))))...((((.(((((.(((((((.((((((...(((((.(((...((.(((...((((((.(((.....))).))))))...))).))....))))))))..))))))..)))..)))))))((((((.((.((.((((..((((.((((((((((((((.((((....)))).).)))))))))......(((((((((...(((((((((..((((((.......))))))..(((((((((((..(((((..((((.......)))).))))))))).))))))).(((((......))))).(((((..(((....))).....).))))..((....))...)))))))))...)))))))))...)))).))))...)))).)))).)))))).)).)))).)))))).)).))))))))))))...))))).)).)))......)))))...)))))....))))..)))))))...))))..........

Thermodynamic Ensemble Prediction

..,{{{,{,,((({,{.,.,,,||,.|,,((({(((.(((((..{{..,.{{.|..}})}}.)})||||||.,{{...,))}}})..(((({...,{{({(...,,|}}|}....))))){{{....)))...,.,,{{(||.,,|||}}.(((((.,...(((.(((((((...((((({{,.,......}}((((((((((((((((((.,,,}}}.((..(((((((((((({.((((.,,.......(((((((.((....(((((((((.............{((({{,.||||,,,..,||{|||{{{{||,||.......,,}||}....{{,....,,,...))}))|||,..,||{..((((((((......))).)))))))}.,.)))))))))..)))))))))..((((.(((((((((((((((((((..((((((((((((((((............(((((((((..(((.(((......))).))).....)))))))))..)))))..))))))..))))))))))))))).)))).(((((.(((((.,....,.))))))))))..)))))))).)))).}....)))).))))))))}}...,{{((,,,,.,}}}|..,,}|||||}||||({{{.{{{{{.{{{{||||||||,,...(((((.(((...((.(((...((((((.(((.....))).))))))...))).))....)))))))),,),}))),.,)}..))))))}((((((.(,{((.((((..((((.((((((((((((((.((((....)))).).)))))))))......{((((((((...(((((((((..{(((((..,,...}))))),.(((((((((((..(((((..((((.......)))).))))))))).))))))).(((((,....,))))).(((({.{(({....})).,...}.))))..||....)}...}))))))))...))))))))}...)))).))))...)))).)))).)))))).||.,,,)})))))))}}.))))))))))))...))))).)).))).,...,)))))....,,)}}...},)}..,,.}}}}..,||,},}...)}}..