Basic Information

Symbol
BIRC2
RNA class
mRNA
Alias
Baculoviral IAP Repeat Containing 2 C-IAP1 RNF48 MIHB Hiap-2 CIAP1 API1 Baculoviral IAP Repeat-Containing Protein 2 RING-Type E3 Ubiquitin Transferase BIRC2 TNFR2-TRAF-Signaling Complex Protein 2 NFR2-TRAF Signalling Complex Protein Cellular Inhibitor Of Apoptosis 1 Inhibitor Of Apoptosis Protein 2 RING Finger Protein 48 Apoptosis Inhibitor 1 IAP Homolog B HIAP2 Baculoviral IAP Repeat-Containing 2 EC 2.3.2.27 HIAP-2 IAP-2
Location (GRCh38)
11:102347208-102378680
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001166.5
Sequence length
3764.0 nt
GC content
0.3743

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-978.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1057.22 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 949.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001166.5 NCBI
AUCGUGCGUCAGAGUGAGCCCGGAUGGGGCGGCGGGCUUCGGGAGCGCC… 3764 nt 0.3743
NM_001256163.1 NCBI
GCGGUGAGUGCUGCUCCUUCCGGGCUCGGGCGGCGUGGGGCGGGUGGGG… 4088 nt 0.3787
NM_001256166.2 NCBI
AUCGUGCGUCAGAGUGAGCCCGGAUGGGGCGGCGGGCUUCGGGAGCGCC… 2361 nt 0.4049
Summary

The protein encoded by this gene is a member of a family of proteins that inhibits apoptosis by binding to tumor necrosis factor receptor-associated factors TRAF1 and TRAF2, probably by interfering with activation of ICE-like proteases. This encoded protein inhibits apoptosis induced by serum deprivation and menadione, a potent inducer of free radicals. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2012]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the BIRC2 (BIRC2) was upregulated in common in spleen leukocytes across all three injury models of trauma/hemorrhage, burn, and LPS infusion at a 2-hour post-injury time point, where it was assigned to pathways involved in cell death [Brownstein et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00213.2005]. This upregulation was part of a common early transcriptional response to systemic inflammation, and the expression pattern for this and other genes in the cell death pathway was validated by RT-PCR, showing good correspondence with microarray findings.