Basic Information

Symbol
BMP5
RNA class
mRNA
Alias
Bone Morphogenetic Protein 5 BMP-5
Location (GRCh38)
6:55753653-55875595
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_021073.4
Sequence length
3970.0 nt
GC content
0.3617

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-971.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1051.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 980.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001329754.2 NCBI
ACUCUUUAGAUCUCUCUUGAAGAGGGCUGGUAUAUUUGUGCCUGCUGGA… 3859 nt 0.3597
NM_001329756.2 NCBI
ACUCUUUAGAUCUCUCUUGAAGAGGGCUGGUAUAUUUGUGCCUGCUGGA… 3782 nt 0.3577
NM_021073.4 NCBI
ACUCUUUAGAUCUCUCUUGAAGAGGGCUGGUAUAUUUGUGCCUGCUGGA… 3970 nt 0.3617
Summary

This gene encodes a secreted ligand of the TGF-beta (transforming growth factor-beta) superfamily of proteins. Ligands of this family bind various TGF-beta receptors leading to recruitment and activation of SMAD family transcription factors that regulate gene expression. The encoded preproprotein is proteolytically processed to generate each subunit of the disulfide-linked homodimer, which plays a role in bone and cartilage development. Polymorphisms in this gene may be associated with osteoarthritis in human patients. This gene is differentially regulated in multiple human cancers. This gene encodes distinct protein isoforms that may be similarly proteolytically processed. [provided by RefSeq, Jul 2016]

Forensic Context

A study in porcine skin demonstrated that the BMP5 was significantly decreased in all experimental groups following cutaneous bromine exposure, being involved in the axonal guidance signaling pathway [Price et al. DOI:10.1016/j.toxlet.2008.08.007].