Basic Information

Symbol
BMPER
RNA class
mRNA
Alias
BMP Binding Endothelial Regulator CRIM3 Cv2 Bone Morphogenetic Protein-Binding Endothelial Cell Precursor-Derived Regulator BMP-Binding Endothelial Regulator Protein BMP-Binding Endothelial Regulator Precursor Protein Protein Crossveinless-2 Crossveinless-2 Crossveinless 2 KIAA1965 CV-2 HCV2
Location (GRCh38)
7:33904308-34156427
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001365308.1
Sequence length
5287.0 nt
GC content
0.4409

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1631.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1731.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1473.50
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001365308.1 NCBI
GACUGUGAGCUGCGGCAGCUGAGCAGAGGCGGCGGCGCGGGACCUGCAG… 5287 nt 0.4409
NM_001410872.1 NCBI
GACUGUGAGCUGCGGCAGCUGAGCAGAGGCGGCGGCGCGGGACCUGCAG… 4957 nt 0.4297
NM_133468.5 NCBI
AGUGGAGACGCGCCUUCUCGGCUCUGGUCCGCGCCCUGGGGCCCUGGCC… 5582 nt 0.4572
Summary

This gene encodes a secreted protein that interacts with, and inhibits bone morphogenetic protein (BMP) function. It has been shown to inhibit BMP2- and BMP4-dependent osteoblast differentiation and BMP-dependent differentiation of the chondrogenic cells. Mutations in this gene are associated with a lethal skeletal disorder, diaphanospondylodysostosis. [provided by RefSeq, Dec 2011]

Forensic Context

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