Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_133468.5
Sequence Length
5582 nt
GC Content
0.4572
AGUGGAGACGCGCCUUCUCGGCUCUGGUCCGCGCCCUGGGGCCCUGGCCUCCCUGGAGGGGCUGGGGAACUGGAAGCUGGGCCGAGAGAGUUCCCGCUGCAGCUAUCGCGCAGUCCCUCCUGCGCCCGGGCGCCCCCAGCGGGUUCCGGGAGGCGCCCGGUGAGCCCACGUCUGUUGCGGCGGAGCGAGCGCGCUCCGGGAGGGCCGAGAGCCGGCGGGGCUGGCAGGAGCUCUCGGGCGCCCGCCUCCCUCCUUCGCGGACGGUCUCCCGACACGCCGGCUGAGAGCCCUUUUCGACUGUGAGCUGCGGCAGCUGAGCAGAGGCGGCGGCGCGGGACCUGCAGUCGCCAGGGAUUCCCUCCAGGUGACGAUGCUCUGGUUCUCCGGCGUCGGGGCUCUGGCUGAGCGUUACUGCCGCCGCUCGCCUGGGAUUACGUGCUGCGUCUUGCUGCUACUCAAUUGCUCGGGGGUCCCCAUGUCUCUGGCUUCCUCCUUCUUGACAGGUUCUGUUGCAAAAUGUGAAAAUGAAGGUGAAGUCCUCCAGAUUCCAUUUAUCACAGACAACCCUUGCAUAAUGUGUGUCUGCUUGAACAAGGAAGUGACAUGUAAGAGAGAGAAGUGCCCCGUGCUGUCCCGAGACUGUGCCCUGGCCAUCAAGCAGAGGGGAGCCUGUUGUGAACAGUGCAAAGGUUGCACCUAUGAAGGAAAUACCUAUAACAGCUCCUUCAAAUGGCAGAGCCCGGCUGAGCCUUGUGUUCUACGCCAGUGCCAGGAGGGCGUUGUCACAGAGUCUGGGGUGCGCUGUGUUGUUCAUUGUAAAAACCCUUUGGAGCAUCUGGGAAUGUGCUGCCCCACAUGUCCAGGCUGUGUGUUUGAGGGUGUGCAGUAUCAAGAAGGGGAGGAAUUUCAGCCAGAAGGAAGCAAAUGUACCAAGUGUUCCUGCACUGGAGGCAGGACACAAUGUGUGAGAGAAGUCUGUCCCAUUCUCUCCUGUCCCCAGCACCUUAGUCACAUACCCCCAGGACAGUGCUGCCCCAAAUGUUUGGGUCAGAGGAAAGUGUUUGACCUCCCUUUUGGGAGCUGCCUCUUUCGAAGUGAUGUUUAUGACAAUGGAUCCUCAUUUCUGUACGAUAACUGCACAGCUUGUACCUGCAGGGACUCUACUGUGGUUUGCAAGAGGAAGUGCUCCCACCCUGGUGGCUGUGACCAAGGCCAGGAGGGCUGUUGUGAAGAGUGCCUCCUACGAGUGCCCCCAGAAGACAUCAAAGUAUGCAAAUUUGGCAACAAGAUUUUCCAGGAUGGAGAGAUGUGGUCCUCUAUCAAUUGUACCAUCUGUGCUUGUGUGAAAGGCAGGACGGAGUGUCGCAAUAAGCAGUGCAUUCCCAUCAGUAGCUGCCCACAGGGCAAAAUUCUCAACAGAAAAGGAUGCUGUCCUAUUUGCACUGAAAAGCCCGGCGUUUGCACGGUGUUUGGAGAUCCCCACUACAACACUUUUGACGGUCGGACAUUUAACUUUCAGGGGACGUGUCAGUACGUUUUGACAAAAGACUGCUCCUCCCCUGCCUCGCCCUUCCAGGUGCUGGUGAAGAACGACGCCCGCCGGACACGCUCCUUCUCGUGGACCAAGUCGGUGGAGCUGGUGCUGGGCGAGAGCAGGGUCAGCCUGCAGCAGCACCUCACCGUGCGCUGGAACGGCUCGCGCAUCGCGCUCCCCUGCCGCGCGCCACACUUCCACAUCGACCUGGAUGGCUACCUCUUGAAAGUGACCACCAAAGCAGGUUUGGAAAUAUCUUGGGAUGGAGACAGUUUUGUAGAAGUCAUGGCUGCGCCGCAUCUCAAGGGCAAGCUCUGUGGUCUUUGUGGCAACUACAAUGGACAUAAACGUGAUGACUUAAUUGGUGGAGAUGGAAACUUCAAGUUUGAUGUGGAUGACUUUGCUGAAUCUUGGAGGGUGGAGUCCAAUGAGUUCUGCAACAGACCUCAGAGAAAGCCAGUGCCUGAACUGUGUCAAGGGACAGUCAAGGUAAAGCUCCGGGCCCAUCGAGAAUGCCAAAAGCUCAAAUCCUGGGAGUUUCAGACCUGCCACUCGACUGUGGACUACGCCACUUUCUACCGGUCCUGUGUGACAGACAUGUGUGAAUGUCCAGUCCAUAAAAACUGUUAUUGCGAGUCAUUUUUGGCAUAUACCCGGGCCUGCCAGAGAGAGGGCAUCAAAGUCCACUGGGAGCCUCAGCAGAAUUGUGCAGCCACCCAGUGUAAGCAUGGUGCUGUGUACGAUACCUGUGGUCCGGGAUGUAUCAAGACGUGUGACAACUGGAAUGAAAUUGGUCCAUGCAACAAGCCGUGCGUUGCUGGGUGCCACUGUCCAGCAAACUUGGUCCUUCACAAGGGAAGGUGCAUCAAGCCAGUCCUUUGUCCCCAGCGGUGACCUUUGUUUCGAUCCUUAAGACUCUGAAAUCUGGUGACUUUGACACUGAAGCGGAAGAGCCAAUGAAGGACUGCAGUAUUUGUGUGCCCGAUUCUGUAAACACACACACACAGAGUAUAUAUGUGUAUAUAUAUAUAGAUAUAUUCAAAAACAUUGCAUCAUUUAUAUGAACUAUAGGGGGAUUAUUAUAUGUAUAUUUUUUGCUAUAAGACAUGUAUUGUUUCUAGGAUCCUAACCUGUAAGCCAUUGAACAUGUUGUAUAAAUACACCAGGUGUUUUUAAUUUAAUAAGGUGGCAUGCAGAUACAUUGGAUAGUGUUAACAUCACAUACAUUUGUCAUUUUUAAGGAAGUUUUCUAAGAGCCCUCAAUUGCCUGCCUGUAUUAAUUUUAGUUUUGAGUCAGGAUUUGUAAUGGAGUGGGAAAUGUGUUUCUCUGGAGAAGGGCACAUUUAUCUAGGGGCAUUUCAGGUUUCCAAAGAAAGGAAUGUAUGCCUGGGAAAGACAGCAGGAGAUUGGUGACCGGCCCUAAUGGUGCAUGAAAAGCGAGUGAUAGGCUGUUAGAAUGUAUUAGGUCAUGGGCUAACAUUAUUUCCAAAAUUGAUUGGCUGGUUGCCAAGAAAUAUAUAUUUGUCACUAGGGCAUAACCGAAGAAUCAAGUGAUUUCUUGCCAUCCUUGCGUAGUCCUCAAGUCUUCUAAUCAUCUAUGUGUGUAUGAUGGAUGUGACCAUUUAUAUGUCAUGUGUUGAAAUUAAAGGGUGUCUGGAUGCCAUGUUAAUUUUAUUGAGCAUGAGAAAGUAUUUGAAGAAACUGUUGCACAACAUAUGAUGAAAUUUUGAUUUCUCUGAAUCUCAGAGUAAUUUAAGAUGGGCAAAUCCAAUGAGUUGAUGUAACCCAUCUACAUUUUGUGGCUAUUUCAUGUAUAAAAUGAAAGGCUUUAGUUAUUUCUAGAGGAGUCCCAUCCAACACUAUUUGGCGACUGUUAAUAUGUUAUAAUUAUUAGACAGUGGAAAAGCCUUUAUUGACUAAUUGAUUUAACCUCAGUCCAAAGAACAGUCUCUAUACUUGCCCUCAUUUACUGAUAGGCUGCUACUAGUUACCAUUUGAUUGUCUUGACUUUCGUCUUCAGUUGAAUUGGUGAAAACAUCAACAAAAACAAAACCCACUGUGUCUUAAAAUAAAAUGUUCUGCAUUGUAGUCAAUAAAGGGCUUAAGAUGUAAAACAAUGCAUUUUCUCUCUCAAGAUGUCCUGUGUUAUACUUUACAAUUAGUUGUAUCAACUUCAGAUUCAUUAAAUUUUAACAGCUGUAUUUAGUUAUAAUUUUUGUAUCUUACAACAGUAUAUAUAAAGACUAUUAUUAAUAGACAAAAGCAAACCCACGUUUUUGACAAGCCAGCAUAUUGCCAAUGCUCGUCAAAGACAUUUAUGUUUCUUUUACAUUCAUGACAGCUAAAGUAUUAACUUGGAAUUUUUUUUUUUUUUUUUGACUGGAAAAUCCCUAGUUGUUUGAAUUAACUGAAUAAAGUGCAGGGCGUAAUAGUGACUGGCUGGGGGCACUGGGCCUUUGUGUUUUUUUUCAUUCCUGUGUUUGGAUACUAAUCACCCUCGUAUCUGCAGCCUGAGGUAGUCAGGUCAUUGUUUCAAUGCUGCCCUUGGAAAGAAGACUUUGACUUAGGUGCUUUGGGAUCUAAGUGUGGUUUGUGACUAUCCCCAUUAUUUAAGCAUUUGGGGGUCUCACUUUUGCUUAUCUGUAACACAAAGAGGCCAUGUAGUAUAGUGAGCAGGGUUGAGAAUCGGGAAAACUAGACCCCUGCCACUAACAGGCUAGGAGACUUUGGGCAGUAAUGGGAGGCACUGAGGGUUUGCAAAUACUUUCCUACUUGUAAUCUCAUUGAUUCCCUGCUCUGCCCUGACAGGAGGGGUAGGGAAAAUCAGUUGACGUUGCCUGGUGGUUCCUACCUUCUGUAAAACGAACAGAUUCCUUAAGAUUAGCUUUAAAUCCCUUUUCAGUUCACUGUUGGUUCUCAUCUUUGAAAGAGGGCAGCAUAAGGGAAAUGAUGGAGAAGGGAGAAUUGUGGAUGGUUAUUUAUAGCUCAUGAUUCAUCCAAGGACUGAGUUAUUCUCCCCAUGAGGCUAACCGGCCUCUUUCCCAACACUUAAUCAUGGCAGCCAGGAUGGGUGAAUGAUGAAAGCUCUUCUGCAUGAGCCGGUUUCAUCAUCUUGGGUGGGUUGAUUACAAGUUUGUGUGGCAUUCCUUUAGCUGGGGAUUAGCUUAAUCUCUGUACAUUUUUCUCAUUUCUAAUUGAAGAAGAAAGGGAGGGCAGAGAGGACAGAAAAUUACUUGGGUUUACUAAUUCAAAGAGCCAUCUCUGAUGGGAGAGGGUGAGGAAAUCAGCUGAAUGGUUGGCCUGCAUAUUCUUUUUUAGGCCACAGGCUACAGCUGAGCAAUGGCUUAGUCUAAUGAUUGGGCACAAUGAGGAUUUACCAAGUGCUUCAAUGAGAGCAGUCCUGUUUCAUUCACAUGGGAUGUUUUCAAUUGGUUCUUCAACUAAGCUCUUGCAGAGUGAGAUGACU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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1797.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1901.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 1503.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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