Basic Information

Symbol
XPO1
RNA class
mRNA
Alias
Exportin 1 CRM1 CRM-1 Emb Chromosome Region Maintenance 1 Protein Homolog Exportin 1 (CRM1 Homolog, Yeast) Exportin-1 Exp1 Exportin-1 (Required For Chromosome Region Maintenance) Chromosome Region Maintenance 1 Homolog (Yeast) Chromosome Region Maintenance 1 Homolog Exportin 1 (CRM1, Yeast, Homolog)
Location (GRCh38)
2:61476032-61538753
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003400.4
Sequence length
4988.0 nt
GC content
0.3982

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1356.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1461.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1373.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001410799.1 NCBI
GCUGCCGACUCCCUGUUCCUCCAGCAAGGAAACUCGAAAGCUCUCCGGU… 4436 nt 0.3729
NM_003400.4 NCBI
AGGUUCCAAACGCUCCGCGGCGCCAUGGGCUGAAAACUCAACCGAGAUG… 4988 nt 0.3982
Summary

This cell-cycle-regulated gene encodes a protein that mediates leucine-rich nuclear export signal (NES)-dependent protein transport. The protein specifically inhibits the nuclear export of Rev and U snRNAs. It is involved in the control of several cellular processes by controlling the localization of cyclin B, MPAK, and MAPKAP kinase 2. This protein also regulates NFAT and AP-1. [provided by RefSeq, Jan 2015] CIViC Summary for XPO1 Gene

Forensic Context

A single-nucleus transcriptomics study of human postmortem nucleus accumbens tissue identified the XPO1 as significantly upregulated in microglia (MGL) cell types in individuals with alcohol use disorder (AUD) compared to controls [Van Den Oord et al. DOI:10.1111/Adb.13250].