Basic Information

Symbol
ACOD1
RNA class
mRNA
Alias
Aconitate Decarboxylase 1 CAD IRG1 Cis-Aconitic Acid Decarboxylase Cis-Aconitate Decarboxylase Immune-Responsive Gene 1 Protein Homolog Immunoresponsive 1 Homolog (Mouse) Immune-Responsive Gene 1 Protein Immunoresponsive 1 Homolog Aconitate Decarboxylase EC 4.1.1.6
Location (GRCh38)
13:76948511-76958638
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001258406.2
Sequence length
2147.0 nt
GC content
0.4746

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-664.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -709.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 582.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001258406.2 NCBI
ACUCCUCUGGUUCACUCCUCCUGAACUGAACCUCUUCUUUACAACGAAA… 2147 nt 0.4746
Summary

Enables aconitate decarboxylase activity and protein homodimerization activity. Involved in defense response; positive regulation of antimicrobial humoral response; and tolerance induction to lipopolysaccharide. Predicted to be active in mitochondrion. Biomarker of esophageal carcinoma and head and neck squamous cell carcinoma. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ACOD1 transcript, associated with macrophage inflammatory response, was upregulated following cryolesion-induced traumatic brain injury and its expression was affected by microglial interleukin-6 deficiency [Sanchis et al. DOI:10.1002/glia.23758]. In a separate investigation of postmortem transcriptome dynamics in zebrafish and mouse, the ACOD1 transcript was identified as an immunity gene with increased abundance at 12 hours postmortem in zebrafish [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].