Basic Information

Symbol
BRINP3
RNA class
mRNA
Alias
BMP/Retinoic Acid Inducible Neural Specific 3 DBCCR1L1 DBCCR1L FAM5C Bone Morphogenetic Protein/Retinoic Acid Inducible Neural-Specific 3 BMP/Retinoic Acid-Inducible Neural-Specific Protein 3 Family With Sequence Similarity 5, Member C DBCCR1-Like Protein 1 Protein FAM5C
Location (GRCh38)
1:190097658-190478404
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_199051.3
Sequence length
3128.0 nt
GC content
0.4434

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-851.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -914.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 773.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001317188.2 NCBI
AGUCCGGUCGUCCUGCCUGACAAGCCAGUGCCAUCAGAGUCCGUGACUU… 2728 nt 0.4428
NM_199051.3 NCBI
ACUAGUUCUCUCUUUAUCUCGUUGUCUUCAACACAUCCUUUUACUUCUC… 3128 nt 0.4434
Summary

This gene is overexpressed in pituitary tumors but is underexpressed in tongue squamous cell carcinomas, ulcerative colitis, and peri-implantitis. Polymorphisms that increase expression of this gene have been shown to increase vascular inflammation, and an association of this gene with myocardial infarction has been demonstrated. Finally, hypermethylation of this gene may find usefulness as a biomarker for gastric cancer. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2015]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the BRINP3 is predominantly expressed in the atrial cardiomyocyte cluster aCM2, which is associated with the metabolic regulation of cardiomyocytes in the right atrium following myocardial infarction [Bian et al. DOI:10.3892/mmr.2025.13680].