Basic Information

Symbol
BROX
RNA class
mRNA
Alias
BRO1 Domain And CAAX Motif Containing C1orf58 BRO1 Domain-Containing Protein BROX FLJ32421 BRO1 Domain- And CAAX Motif-Containing Protein Chromosome 1 Open Reading Frame 58 BRO1 Domain Containing Protein BROFTI
Location (GRCh38)
1:222711691-222735196
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_144695.4
Sequence length
4104.0 nt
GC content
0.3745

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1025.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1107.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1057.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001288579.2 NCBI
ACUGCGCCGAGGGCCGCCAUCGCUAUUGCGGCAUUCUCCCUCGGCUCCG… 4008 nt 0.3748
NM_001288580.2 NCBI
UAAACAGGAAGUGGGCGCUCAGAGCUCGGGGGCGGCGCUCAGAAAACAU… 3671 nt 0.3577
NM_001288581.2 NCBI
UAAACAGGAAGUGGGCGCUCAGAGCUCGGGGGCGGCGCUCAGAAAACAU… 3607 nt 0.3549
NM_001375661.1 NCBI
UAAACAGGAAGUGGGCGCUCAGAGCUCGGGGGCGGCGCUCAGAAAACAU… 3767 nt 0.3578
NM_001375758.1 NCBI
UAAACAGGAAGUGGGCGCUCAGAGCUCGGGGGCGGCGCUCAGUGACUUG… 3650 nt 0.3567
NM_144695.4 NCBI
ACUGCGCCGAGGGCCGCCAUCGCUAUUGCGGCAUUCUCCCUCGGCUCCG… 4104 nt 0.3745
Summary

Involved in mitotic nuclear membrane reassembly. Located in nuclear envelope. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the BROX mRNA was significantly upregulated in gastric tissues following 6 Gy or 12 Gy X-ray irradiation, identifying it as a potential biomarker for radiation-induced gastric injury [Chen et al. DOI:10.1177/1559325819886766].