Basic Information

Symbol
BTBD16
RNA class
mRNA
Alias
BTB Domain Containing 16 C10orf87 BTB/POZ Domain-Containing Protein 16 Em:AC061711.1 FLJ25359 Chromosome 10 Open Reading Frame 87 BTB (POZ) Domain Containing 16
Location (GRCh38)
10:122271296-122338159
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_144587.5
Sequence length
1856.0 nt
GC content
0.5016

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-581.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -615.56 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 478.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((.(((((....(((((((((..((....(((((((.((((.((((((.((.(((...(((((.(((...((.((...((((........))))...))))....))).)))))...))).))......(((.((..((((((.((((((...))))...)).))))))..)))))....(((....)))))))))..)))))))))))...))..))))))))).....))))).))....(((.((((.((((((.......((......(((....(((((((......)))))))...(((.....)))((((((((.....((((((((((((((((...(((((((((((((((..(((((((.((((...((.((.((((...(((((((.(((((..((((((...((((..(((((.(.((.........(((.(((((((((....)))))))))........((....))...(((((((........((.((((...(((..(((((((.....(((((((((.((((((((.....((((((...(((..(((....))))))...))))))((((((...))))))................))).))))).)))))))))..)))))))..)))...))))...))........))))).))......((((.(((......))).))))..(((((....)))))((..((..(((........))).))..)).(((((.((....))))))))))........)).).))))).))))((((.((((((..((..(((((((....((......((((.......))))))..))))))).))..))))))))))..(((.((((((.((.(((........((.((((((((((((((..(((((((((.(((.....((((((((.....))))))))....(((..((((((..(((((((((((((((.(((...................))).))))..(((...))).....)))))))((((.....)))))))).)))..)))..)))........(((.(((((((((((...((((..(((((........)))))))))....))))))))))).)))...........(((((..((.(((((.(..(((.(.(.....).).)))..).))))).))..)))))))).))))))))).))))))))...)).)))).)).((........)).))).))))))))..))).))))))...))))))))))))...)))))))).((((......)))).......)))))))).)))))))))))....))))).)).)))..............))))))).....))))))..(((((.....)))))............(((....))).........(((((((((((((((((((...(((((((...((((..((((.......)))).....))))..)))......((.(((((...((((.....((((((((((((.((.((...((((.((..(((.......)))..)).))))...)).)))))))...)))))))....(((....(((.....((((((.....((.((..((((((.........))))))..)).))......))))))....)))..))).......))))..))))).))..........((((((...))))))......))))...)))))))........))))))))))))((((...)))).)))))))).)))......)).......)))).)).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
......{(.(((((....(((((((((..((....(((((((.((((.((((((.{{.(({...(((((.(((...{,.((..,((((,,,....,))))}}.))}}....))).)))))...))).}}......(((.((..((((((.,{((((...}))).},},.))))))..)))))....(((....)))))))))..)))))))))))...))..))))))))).....))))).)}....(((.((((.{,((((......|((|,...,|{,....{((((((......)))))}}..,|{|,....))}{(((((((.{,..((((((((((((({(,{{.(((((((((((((((.{(((((((.((((...((.({.((((.,.(((((((.(((((..((((((.,,(,,,..,||||,{.{{,,{{,,...({,{((,(((((({,{{||||}}}))..,.....((....))...((((,(({(,.{,{{({.((((,..(((..((((((({...,(((((((((.((((((((.,...{(((((...{((..{{{....}))})),..})))))|{{{{|,,.))))))............,,|.))).))))).)))))))))}.)))))))..)))...}))}...,.........||||{{....,||||({(.(((..,...}}}.}}}}..(((((....))))).....|}}|||}}}.}}|}{{{{{{|||,.{((((.{{....)))))))|||{.......||{{,|.||,.||}}{{{{,{{||||,,||..{{{||{|,|},.|}}}}.}|||{.......}|||||.,||}}}}}.|}..}}}))}}}}}..{||,{|||||.{{.,{|..||||..({.((((((((((((((..(((((((((.((({,...((((((((.....))))))))...,||,,.|{||||,,||,,(((((((((((.(((...................))).)))),,{{{...}}}.,|..)))))))((((...,,}|}|{{,|,||,,.,},,|..,,},.....{{(.(((((((((((...((((..((((({{...,}.)))))))))....))))))))))).})},.,|,{{.{{{{{{,({.{{.||{||,|,,{||,|.{.....},}.}))..),))))}.})}}))))}})).))))))))).))))))))...)).)))).)).{{.,,}}..}))}))))),))})))..))).))))))...)))))))))))).,.)))))))).((((......)))).......)))))))),)),))))))))....))))).)).)).,},...........))))))).....)))))).,|((({.....})))},........,,.{({....))}.,.......(((((((((((((((((((...((((,{(...,,||,.,,,,.,,,,,,|,||....})))).})))......((.(((((...((((.....((((((((((((.((.((...((((.((..(((.......)))..)).))))...)).)))))))...)))))))....(((....(((.....((((((.....((.((,.((((((,........)))))).,)).))......))))))....)))..)))..}....))))..))))).)).......,..((((({...})))))......))))...)))))))........))))))))))))((({...}))),)))))))),|,,.....,},.......)))).},.})))))}

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001318189.3 NCBI
ACAACCACCCAGGAAACCAAGGCAAGCUCCCCCUGUCAAAGCACCUUGG… 1859 nt 0.5019
NM_144587.5 NCBI
ACAACCACCCAGGAAACCAAGGCAAGCUCCCCCUGUCAAAGCACCUUGG… 1856 nt 0.5016
Summary

This gene encodes a protein that contains a BTB/POZ domain. This domain mediates protein-protein interactions. A mutation in this gene may be associated with bipolar disorder. [provided by RefSeq, Sep 2016]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the BTBD16 was significantly upregulated in the inguinal white adipose tissue of aged burn mice compared to controls, where it may be involved in cell proliferation [Bhattachan et al. DOI:10.1096/fj.202501420R].