Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_144587.5
Sequence Length
1856 nt
GC Content
0.5016
ACAACCACCCAGGAAACCAAGGCAAGCUCCCCCUGUCAAAGCACCUUGGCCCAUAAGAAGAAAAGGGGGAGCCCCAGAUGUGAUGAGCGCUUCCAGGCUUCAGGCUCAGAAGGCGCCCCCAGCUCUCCUGUAACUCAGAGGCCAGUGUGAUGGGAGUUCCUCCACUCAGCACACUUCCCCUGUAAACACGCCUGUGGUGGGCAAAAGGGCUUUGGAACGGUUGCUUGUCUUUUCUCUCCUGCGUAAUUUCCACUUUCAUUCAUGAUAAUGUCGAACACGCACAAAGCUCGGCUGGAACGCCGGGUCACUGGCUCAACCAACCGGUGGCGUUUGCCCAAACAGCCUUUCUCUGGGGACCUGCUCUCACUUUCCCAGAUGUGCAAGGCUCUGAGCAUAGACUUUGAGGAAGCUUUGAGGAACCCAGACAGGUUAUGCAUUUCACAAAUCCAGAAGUUUUUCUUUGAGAAUUUCAAGAACAAGGACAUCCAAAGUGGGGAAGCAGAUGUGAUUCUCGAGUGCCUGGGCUUCAAAUGGGAGCUCCAUCAGCCCCAGCUUUUUCAGUCUGAGACCUUGGCCAAGCUCUACCUGAAAGCCCUGGCGCAGGGCACCACACACCCCCUGAGGGAGCUGGAGGAGCUUCUGCGAGCUCAAUCACCUAAGAAGACCAAAGAAAAAUCCCCUGCAAAGAGGAUCAUCAUUUCCUUGAAGAUCAAUGACCCACUGGUCACUAAAGUCGCCUUCGCCACGGCCCUGAAGAACCUCUACAUGAGUGAGGUGGAGAUUAACUUGGAAGACCUACUGGGAGUGCUGGCUUCCGCCCACAUCCUCCAGUUCAGUGGCCUGUUUCAAAGGUGCGUGGAUGUGAUGAUAGCCAGACUCAAGCCAAGCACCAUCAAGAAAUUCUACGAGGCCGGCUGCAAGUACAAGGAAGAGCAGCUCACCACCGGCUGCGAGAAGUGGCUGGAAAUGAACUUGGUUCCUCUAGGGGGGACGCAGAUCCACCUCCACAAAAUCCCACAGGACCUGCUCCACAAAGUGCUGAAGUCCCCCAGGUUAUUUACCUUUAGUGAAUUCCAUCUUCUGAAAACAAUGCUUUUGUGGGUCUUCUUGCAACUGAACUACAAGAUUCAGGCAAUUCCGACUUAUGAAACCGUGAUGACAUUUUUUAAGAGCUUUCCUGAGAACUGUUGCUUUCUGGACCGGGACAUAGGACGGAGCUUGAGGCCGCUCUUCCUCUGCUUGCGUCUGCACGGCAUCACCAAAGGCAAGGAUCUGGAGGUGCUGCGGCACCUUAACUUCUUCCCAGAGUCAUGGCUCGACCAGGUUACAGUCAACCAUUACCACGCACUGGAGAAUGGGGGCGACAUGGUCCACCUGAAAGAUCUUAACACCCAGGCUGUGAGAUUUGGGCUGCUCUUUAACCAGGAGAAUACAACUUAUUCGAAAACGAUUGCUCUAUAUGGAUUCUUCUUUAAGAUAAAGGGACUCAAACAUGAUACUACCUCUUAUAGUUUUUACAUGCAGAGAAUAAAGCACACAGACCUGGAAUCUCCCUCUGCGGUCUACGAGCACAACCACGUCAGCCUGCGAGCGGCACGCCUGGUGAAGUAUGAGAUCAGAGCAGAGGCCCUGGUUGACGGCAAGUGGCAGGAGUUCAGGACAAACCAGAUCAAGCAGAAGUUUGGGUUGACCACGUCAUCCUGCAAAAGCCAUACCUUGAAAAUCCAAACUGUGGGCAUCCCAAUCUAUGUAAGUUUUGCAUUCAUCUUCCCAGCAUCUUGACAGUUUCCAGAAGAAUCUAUGGGAUUUUCCCCCCACUGGUCUGCAUAAAAGAAAAUAAAAUGACAUAAAAGGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-581.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -615.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 478.12
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((.(((((....(((((((((..((....(((((((.((((.((((((.((.(((...(((((.(((...((.((...((((........))))...))))....))).)))))...))).))......(((.((..((((((.((((((...))))...)).))))))..)))))....(((....)))))))))..)))))))))))...))..))))))))).....))))).))....(((.((((.((((((.......((......(((....(((((((......)))))))...(((.....)))((((((((.....((((((((((((((((...(((((((((((((((..(((((((.((((...((.((.((((...(((((((.(((((..((((((...((((..(((((.(.((.........(((.(((((((((....)))))))))........((....))...(((((((........((.((((...(((..(((((((.....(((((((((.((((((((.....((((((...(((..(((....))))))...))))))((((((...))))))................))).))))).)))))))))..)))))))..)))...))))...))........))))).))......((((.(((......))).))))..(((((....)))))((..((..(((........))).))..)).(((((.((....))))))))))........)).).))))).))))((((.((((((..((..(((((((....((......((((.......))))))..))))))).))..))))))))))..(((.((((((.((.(((........((.((((((((((((((..(((((((((.(((.....((((((((.....))))))))....(((..((((((..(((((((((((((((.(((...................))).))))..(((...))).....)))))))((((.....)))))))).)))..)))..)))........(((.(((((((((((...((((..(((((........)))))))))....))))))))))).)))...........(((((..((.(((((.(..(((.(.(.....).).)))..).))))).))..)))))))).))))))))).))))))))...)).)))).)).((........)).))).))))))))..))).))))))...))))))))))))...)))))))).((((......)))).......)))))))).)))))))))))....))))).)).)))..............))))))).....))))))..(((((.....)))))............(((....))).........(((((((((((((((((((...(((((((...((((..((((.......)))).....))))..)))......((.(((((...((((.....((((((((((((.((.((...((((.((..(((.......)))..)).))))...)).)))))))...)))))))....(((....(((.....((((((.....((.((..((((((.........))))))..)).))......))))))....)))..))).......))))..))))).))..........((((((...))))))......))))...)))))))........))))))))))))((((...)))).)))))))).)))......)).......)))).)).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
......{(.(((((....(((((((((..((....(((((((.((((.((((((.{{.(({...(((((.(((...{,.((..,((((,,,....,))))}}.))}}....))).)))))...))).}}......(((.((..((((((.,{((((...}))).},},.))))))..)))))....(((....)))))))))..)))))))))))...))..))))))))).....))))).)}....(((.((((.{,((((......|((|,...,|{,....{((((((......)))))}}..,|{|,....))}{(((((((.{,..((((((((((((({(,{{.(((((((((((((((.{(((((((.((((...((.({.((((.,.(((((((.(((((..((((((.,,(,,,..,||||,{.{{,,{{,,...({,{((,(((((({,{{||||}}}))..,.....((....))...((((,(({(,.{,{{({.((((,..(((..((((((({...,(((((((((.((((((((.,...{(((((...{((..{{{....}))})),..})))))|{{{{|,,.))))))............,,|.))).))))).)))))))))}.)))))))..)))...}))}...,.........||||{{....,||||({(.(((..,...}}}.}}}}..(((((....))))).....|}}|||}}}.}}|}{{{{{{|||,.{((((.{{....)))))))|||{.......||{{,|.||,.||}}{{{{,{{||||,,||..{{{||{|,|},.|}}}}.}|||{.......}|||||.,||}}}}}.|}..}}}))}}}}}..{||,{|||||.{{.,{|..||||..({.((((((((((((((..(((((((((.((({,...((((((((.....))))))))...,||,,.|{||||,,||,,(((((((((((.(((...................))).)))),,{{{...}}}.,|..)))))))((((...,,}|}|{{,|,||,,.,},,|..,,},.....{{(.(((((((((((...((((..((((({{...,}.)))))))))....))))))))))).})},.,|,{{.{{{{{{,({.{{.||{||,|,,{||,|.{.....},}.}))..),))))}.})}}))))}})).))))))))).))))))))...)).)))).)).{{.,,}}..}))}))))),))})))..))).))))))...)))))))))))).,.)))))))).((((......)))).......)))))))),)),))))))))....))))).)).)).,},...........))))))).....)))))).,|((({.....})))},........,,.{({....))}.,.......(((((((((((((((((((...((((,{(...,,||,.,,,,.,,,,,,|,||....})))).})))......((.(((((...((((.....((((((((((((.((.((...((((.((..(((.......)))..)).))))...)).)))))))...)))))))....(((....(((.....((((((.....((.((,.((((((,........)))))).,)).))......))))))....)))..)))..}....))))..))))).)).......,..((((({...})))))......))))...)))))))........))))))))))))((({...}))),)))))))),|,,.....,},.......)))).},.})))))}
Back