Basic Information

Symbol
BTF3
RNA class
mRNA
Alias
Basic Transcription Factor 3 BTF3a BTF3b NACB Nascent-Polypeptide-Associated Complex Beta Polypeptide Nascent Polypeptide-Associated Complex Subunit Beta RNA Polymerase B Transcription Factor 3 Transcription Factor BTF3 NAC-Beta BETA-NAC
Location (GRCh38)
5:73498408-73505667
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001037637.2
Sequence length
1276.0 nt
GC content
0.4679

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-386.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -411.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 233.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001037637.2 NCBI
CCCUUUAGCUGCCAUCUUGCGUCCCCGCGUGUGUGCGCCUAAUCUCAGG… 1276 nt 0.4679
NM_001207.5 NCBI
CCCUUUAGCUGCCAUCUUGCGUCCCCGCGUGUGUGCGCCUAAUCUCAGG… 1035 nt 0.4145
NM_001393652.1 NCBI
CCCUUUAGCUGCCAUCUUGCGUCCCCGCGUGUGUGCGCCUAAUCUCAGG… 1219 nt 0.4676
NM_001393653.1 NCBI
CCCUUUAGCUGCCAUCUUGCGUCCCCGCGUGUGUGCGCCUAAUCUCAGG… 978 nt 0.4110
Summary

This gene encodes the basic transcription factor 3. This protein forms a stable complex with RNA polymerase IIB and is required for transcriptional initiation. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. This gene has multiple pseudogenes. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.