Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001207.5

Sequence Length

1035 nt

GC Content

0.4145

CCCUUUAGCUGCCAUCUUGCGUCCCCGCGUGUGUGCGCCUAAUCUCAGGUGGUCCACCCGAGACCCCUUGAGCACCAACCCUAGUCCCCCGCGCGGCCCCUUAUUCGCUCCGACAAGAUGAAAGAAACAAUCAUGAACCAGGAAAAACUCGCCAAACUGCAGGCACAAGUGCGCAUUGGUGGGAAAGGAACUGCUCGCAGAAAGAAGAAGGUGGUUCAUAGAACAGCCACAGCAGAUGACAAAAAACUUCAGUUCUCCUUAAAGAAGUUAGGGGUAAACAAUAUCUCUGGUAUUGAAGAGGUGAAUAUGUUUACAAACCAAGGAACAGUGAUCCACUUUAACAACCCUAAAGUUCAGGCAUCUCUGGCAGCGAACACUUUCACCAUUACAGGCCAUGCUGAGACAAAGCAGCUGACAGAAAUGCUACCCAGCAUCUUAAACCAGCUUGGUGCGGAUAGUCUGACUAGUUUAAGGAGACUGGCCGAAGCUCUGCCCAAACAAUCUGUGGAUGGAAAAGCACCACUUGCUACUGGAGAGGAUGAUGAUGAUGAAGUUCCAGAUCUUGUGGAGAAUUUUGAUGAGGCUUCCAAGAAUGAGGCAAACUGAAUUGAGUCAACUUCUGAAGAUAAAACCUGAAGAAGUUACUGGGAGCUGCUAUUUUAUAUUAUGACUGCUUUUUAAGAAAUUUUUGUUUAUGGAUCUGAUAAAAUCUAGAUCUCUAAUAUUUUUAAGCCCAAGCCCCUUGGACACUGCAGCUCUUUUCAGUUUUUGCUUAUACACAAUUCAUUCUUUGCAGCUAAUUAAGCCGAAGAAGCCUGGGAAUCAAGUUUGAAACAAAGAUUAAUAAAGUUCUUUGCCUAGUAUACAGUUUUAUUUUUUUAUUUCAUUGACACCGAUCUGUACACAGUAAAAAAAAUUGCUUAUAGAAAGCUAAUCAUGGCAUGUAAUAUGGCUGAUAACCUUUGGAAUUUGAUUAAAGAUUUAAAAUCACGGUGUAGUGUAACAAAGGUGGUAUAAAGUUCUCAGGUUUGAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-259.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -280.69

Frequency: 0.0000

Diversity: 209.09

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....((((((((............(((((((.(.(.(.(((..((((((.(((((....).)))).)))))).........))).).)))))))))..(((((((..((((.(((((((....(((...(((((.(.((((......((((((((..((((........))))..))))))))....((((((((..(........)..))))))))......((.((((((((((.............((((.(((((((((..(((((((.(((((((.(((((((........)))))))....))))))).......(((.......)))((((((.......))))))...(((((.((((.((((......(((((.(((........))).))))).......)))).)))).)))))..((.(((((............)))))))....)))))))..)))))))))))))((....)))))))..........))))).))....((((.....)))).)))).........).)))))....)))...)))))))))))......))))))).....(((((((((((((((((((...(((.(((((((..((.......))..))))))))))(((((((((.................(((...((((((.....((((...(((((((........)))))))..)))))))))))))(((((...))))).....)))))))))))))))..)))))..........)))))))).))))))))...........((((((((((((...........((((((..........)))))).....(((((.....(((((((......(((((.(((((..(((((...(((((......))))))))))((((...((((.(.((((...)))).)))))...)))).((((((......)))))).......))))))))))....))))))))))))..)))))))))))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

....((((((((......{,,...{|||{{{.(.({(..,...((((((.(((({....}.)))).)))))).........,,).....)))))||..(((((({..((((,{((((((....{{,...(((((.{.{(,,......((((((((..(((,.{{.....))))},)))))))).......{{{(({.({{......|..|((|{{||......{{.{{{{{(((((.,..........{((({{(((((((((..(((((((,(((((((.(((((((........)))))))....)))))))...,,..(((.......)))((((((.......))))))...(((((.((((.((((,.....{{{{{.({{........}}|,|}}}}.....,.)))).)))).)))))..((.(((((............)))))))....,))))))..)))))))))))))|{....}}))))).........,))))).})....,{||}}}},},)).))))}}.},.}.,},)),}}....)))...)))))))))))......))))))).....(((((((((((((((((((...(((.(((((((..((.......))..)))))))))){((((((((.................{{{,..,{((((,....,{,{,{.((((((({,...,}},)))))).}))}})))))))}}(((((...))))).....))))))))})))))),.,))))..........)))))))).))))))))...........((((((((((((,,....,}...((((((........,.)))))).....{{,{{....,{{{{{({,,.,,.((((,{(((((.{(((((..,((({{......)))}})))))},{{...((((.(.((({...}))).)))))...}|||.(({(((,,....}}}})),,,.,}.)))))))))).,,.))))))))}}},..)))))))))))).....