Basic Information

Symbol
C21orf58
RNA class
mRNA
Alias
Chromosome 21 Open Reading Frame 58 Uncharacterized Protein C21orf58
Location (GRCh38)
21:46300181-46324460
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_058180.5
Sequence length
2970.0 nt
GC content
0.6034

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1244.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1296.66 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 681.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001286462.2 NCBI
AAAGAGGAGAGGAAAAAAAGUUAACCAGUUCAACGAAAAGGAGAAUCUG… 1674 nt 0.5926
NM_001286463.1 NCBI
GCUGGUCUCCAGGAGGUAAGGCCCGCCCUGCAGGCAACACCGGUGCUUG… 2002 nt 0.6014
NM_001286476.2 NCBI
AAAAAGUUCGCGCUGCUGGUCCCGCGCGGGCGGCCCCUGGGCUUUGUGU… 2936 nt 0.5988
NM_001286477.2 NCBI
AAAAAGUUCGCGCUGCUGGUCCCGCGCGGGCGGCCCCUGGGCUUUGUGU… 2641 nt 0.6172
NM_058180.5 NCBI
AAAAAGUUCGCGCUGCUGGUCCCGCGCGGGCGGCCCCUGGGCUUUGUGU… 2970 nt 0.6034
Summary

No relevant information is available at the moment.

Forensic Context

A study in human endothelial cells demonstrated that the C21orf58 mRNA was identified as one of the eleven most-significantly regulated transcripts at 24 hours post-irradiation, functioning as a marker to differentiate unirradiated (0 Gy) samples from those exposed to X-ray doses of 1-10 Gy [Chopra et al. DOI:10.1038/s41598-022-24051-6].