Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001286477.2

Sequence Length

2641 nt

GC Content

0.6172

AAAAAGUUCGCGCUGCUGGUCCCGCGCGGGCGGCCCCUGGGCUUUGUGUCCACCAGGACAGCGGGCCGGGCUCCCUGCAGGCGCGGGCGGCGCCGAACGGUGCUCAGCAACCACCCGGACAGGGCCAGGCCGUUUUCUCCCGCUCAGGCAUUAGUCGUUGGCUGUGGGCCGCCGCGGGAAGUUGAGGCCUACCACGGAGGAGGCUGCUGAGGUGGAUCUCAGGGGAUCCGCAAGGGCUCCCUCACCCUUGCCGGGACCCUGGGAACCCGAAACAAAAUCCUACGCCACCAGCCCGCCGAAUGCGCCCCCUCGGCCGGGGGUCCUGGGUCUUCAGAGAAGAACUCGGCCGAAUGCGGUCAGAAAGCCCGCGAACCGCCUGGACCUGCAGGCCCCGCCGCUUGGAGCUCCCGCCUUUCCCGACCGAGCCCGUGUCUGCUCGUGUGUCUCACUGAUGUCUUAGGUCUCAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGGUUUUUAGUAGACAGAAGAGAAAUGGGGCCGUGGGUUCGUGGUCCCAGGGGGAAACUGACGUCGCAUGAGGUCGUCGUCCCUCAGCUUGAGCUCAGCGGAACAUAAGCUUGCAGAGGUGGAAACCACGGAAGGUUUGGGUGUCUUGGAGCUCUCUGGACACCGAAGCCCGGACACAGUCCCGGGGUCCGCACCGCCUGUGACCUGUGGCGGGACCGCCGGGGUGGGCGUUUUCUCAGCUGGCGCGCGCGCUGGUCUCCAGGAGGUAAGGCCCGCCCUGCAGGCAACACCGGUGCUUGGGCUCCUGCUGAGCAGUUCUUUCCUGCGAGUAACAGAACCAGGGAGGGAGGUGGGCUGUGGCCUCCCCUGCCCCUACAGUCGUCUCCUGCAGCUCCCACCAUGCUGGACUCAUCAGCAGCAGAGCAAGUGACCCGACUGACGCUGAAGCUCUUGGGACAGAAGCUGGAGCAAGAACGGCAGAACGUGGAAGGGGGACCUGAGGGCCUCCACCUCGAGCCAGGAAAUGAGGACCGGCCGGACGAUGCCCUGCAGACUGCUCUGAAGAGAAGGAGGGACCUUCUGCAGAGACUCCGGGAGGCCACCCUCAUGCACAUAACCCUGGAAGGGUCUUCCAGUCAUGGCCAUCCUGCCCGGAGAGGCGCCUGUACCUGGCCCAGGCUGGCCUGAGCCUGAUGCUGGGGGUGCCUCUGUGGCGUUGGGGCUCCCCGUCCCCGUGUGCAGCAGCUCUGCAUCGGCCUUGCAGGAACAACACCUCCUGGACGAGCUCUCUCGGGCCCAGGCCUGGAGCGGGCCAAGCAGAGGAGCCCUCGGGUCAGCCCUGCCCCCAGAGCUGCCCCCCACGGGCAUCCUACCCACUGCCUCCCCAUCCCCGCUGGCCCCAGACCCGCCAAGGAUCAUCCUGCCUACGGUCCCCCAGCCUCCUGCCACCAUCAUUCAGCAGCUCCCUCAGCAGCCACUCAUAGCACAGAUUCCUCCUCCCCAGGCCUUCCCUACUCAACGGUCAGGAAGUAUUAAGGAAGACAUGGUGGAGCUGCUGCUGCUGCAGAACGCACAGGUGCACCAGUUGGUCCUGCAGAACUGGAUGCUCAAGGCCCUGCCCCCAGCCCUGCAGGACCCGCCACAUGUGCCCCCGAGGGUCCCACGAGCUGCCAGGCCAAGGCUGCCUGCCGUGCACCACCACCACCACCACCACCAUGCUGUGUGGCCACCUGGGGCUGCCACUGUCCUCCAGCCCGCCCCCAGCCUGUGGACGCCUGGCCCACCCUGAGUGUGAGUCACAGAGACCCUGGCCGGGGCACCCUCCACCCCCAGGCUUCCUCAGGGCUGUGGGCUGUGGCGGGACUAUGGAAGGGAGCAGGGAGAGACCCUGCCACCACCCGGAGUGGCUACGCGAGUGUGGACUGCAGGCUCCUCCUGGGGAAGCUGGGCAGGCUCGCUUUCUGGUCACGGGGCCAUUCCAGGGGGCAUCCCUUGCUCCGGGUCCCCUGCAGUGAGGGGCCUGUGAACCCCACCAGGGCAACAGCCCCUCCCAGGGACCCCUCCUUUCCUGUAGGGCGGCGCCGGCCCACCUGGGAGCCUCAGAUCCCCCUCUUCCAUCACGGAGGUAAAGUUGAGGCCGUGGACGCCACCAGCCUGAUGAAAUAAAGAUUUCAUCCAGAAAGAGUUUAAGAAAAUCUCAGCUCAGGAGCCAGAACAGAAAAGAUCAAUAGCUUUAGCCACAUGGAAGUGUGAACAUCCUGAUGGGGAAAAUACCACAAAGUCUAAUUUAAUAACUAGGGACACCUGUGUCCACAGCUGUGGCACAGACUCCCACUAAAGAAGUAGGGGUGCAUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUAAGAGGCUGAGGCAGGAGGAUCACUUGAGCUCAGGAAUUCGAGACCAGCCUGGGUCACAUAGCAAGACCCCGUCUCUACAAAAAAUAAAUUUAAAAAACUAGCCAGGUGUGGUGAUAUGCGCCUGUUAUCUCAGCAGCUCUGGGGGCUGAGGUGGGAGGAUUGCUUGAGCCCAGGAGUUAGAAGCUGCAGUGAGCUCUGAUGGAACCACUGCACUAUAGCCUGGACCACAGAGCAGGCCCCUGUCUCAAAAAUAAAAUAAAAAAGUGAAAGAAGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1143.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1186.38

Frequency: 0.0000

Diversity: 734.99

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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