Basic Information

Symbol
C3AR1
RNA class
mRNA
Alias
Complement C3a Receptor 1 C3AR AZ3B C3a Anaphylatoxin Chemotactic Receptor Complement Component 3a Receptor 1 HNFAG09 Complement Component 3 Receptor 1 C3a-R C3R1
Location (GRCh38)
12:8056844-8066374
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004054.4
Sequence length
3434.0 nt
GC content
0.4173

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-899.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -961.86 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1078.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001326475.2 NCBI
ACUGUGGCUAAGUGUGGGGACCAGACAGGACUCGUGGAGACAUCCAGGU… 3431 nt 0.4174
NM_001326477.2 NCBI
ACUGUGGCUAAGUGUGGGGACCAGACAGGACUCGUGGAGACAUCCAGGU… 3491 nt 0.4171
NM_004054.4 NCBI
ACUGUGGCUAAGUGUGGGGACCAGACAGGACUCGUGGAGACAUCCAGGU… 3434 nt 0.4173
Summary

C3a is an anaphylatoxin released during activation of the complement system. The protein encoded by this gene is an orphan G protein-coupled receptor for C3a. Binding of C3a by the encoded receptor activates chemotaxis, granule enzyme release, superoxide anion production, and bacterial opsonization. [provided by RefSeq, May 2016]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the C3AR1 was significantly upregulated in plasma and its expression was associated with immune cell infiltration and coagulation dysregulation in a sepsis model [Fang et al. DOI:10.1155/ijog/5684300]. In human studies, the C3AR1 was identified as a core gene highly expressed in sepsis compared to control groups and was predominantly localized within macrophage lineages [Chen et al. DOI:10.1038/s41598-024-59400-0].