Basic Information
Symbol
C4BPA
RNA class
mRNA
Alias
Complement Component 4 Binding Protein Alpha
C4BP
C4b-Binding Protein Alpha Chain
Proline-Rich Protein
PRP
Complement Component 4-Binding Protein, Alpha
C4bp
Location (GRCh38)
1:207102319-207145047
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
MANE select
Transcript ID
NM_000715.4
Sequence length
2272.0 nt
GC content
0.4349
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-654.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-702.04 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
530.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AACCGUCCUUGACCAGCCAACCACAUGGCUGAAAUUCAGGGACUCUUUG… | 2272 nt | 0.4349 |
Summary
This gene encodes a member of a superfamily of proteins composed predominantly of tandemly arrayed short consensus repeats of approximately 60 amino acids. Along with a single, unique beta-chain, seven identical alpha-chains encoded by this gene assemble into the predominant isoform of C4b-binding protein, a multimeric protein that controls activation of the complement cascade through the classical pathway. The genes encoding both alpha and beta chains are located adjacent to each other on human chromosome 1 in the regulator of complement activation gene cluster. Two pseudogenes of this gene are also found in the cluster. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in rats demonstrated that the C4BPA was significantly altered in expression on day 1 after a 20% total body surface area burn injury in liver tissue, where it was classified as an inflammation gene involved in the complement system [Jayaraman et al. DOI:10.1016/j.jss.2007.05.025]. In human sepsis patients, RNA-sequencing of peripheral whole blood identified the C4BPA as a downregulated mRNA compared to healthy controls [Qin et al. DOI:10.1097/JCMA.0000000000000209].