Basic Information
Symbol
CA11
RNA class
mRNA
Alias
Carbonic Anhydrase 11
Carbonic Anhydrase-Related Protein 2
CARPX1
CARP2
Carbonic Anhydrase-Related Protein XI
Carbonic Anhydrase-Related Protein 11
Carbonic Anhydrase XI
CA-RP XI
CA-RP II
CARP-2
CA-XI
CARP XI
CA-RP
Location (GRCh38)
19:48637946-48646386
Forensic tag(s)
-
MANE select
Transcript ID
NM_001217.5
Sequence length
1715.0 nt
GC content
0.5907
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-691.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-721.00 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
354.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AAGAGAGAAGAGAGACUGAAACAGGGAGAAGAGGCAGGAGAGGAGGAGG… | 1715 nt | 0.5907 |
Summary
Carbonic anhydrases (CAs) are a large family of zinc metalloenzymes that catalyze the reversible hydration of carbon dioxide. They participate in a variety of biological processes, including respiration, calcification, acid-base balance, bone resorption, and the formation of aqueous humor, cerebrospinal fluid, saliva, and gastric acid. They show extensive diversity in tissue distribution and in their subcellular localization. CA XI is likely a secreted protein, however, radical changes at active site residues completely conserved in CA isozymes with catalytic activity, make it unlikely that it has carbonic anhydrase activity. It shares properties in common with two other acatalytic CA isoforms, CA VIII and CA X. CA XI is most abundantly expressed in brain, and may play a general role in the central nervous system. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No relevant information is available at the moment.