Basic Information
Symbol
CAB39
RNA class
mRNA
Alias
Calcium Binding Protein 39
MO25
CGI-66
Calcium-Binding Protein 39
MO25alpha
Protein Mo25
Location (GRCh38)
2:230712822-230821076
Forensic tag(s)
-
MANE select
Transcript ID
NM_016289.4
Sequence length
3829.0 nt
GC content
0.4186
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1087.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-1164.86 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1263.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AGUCGGGCGGGCGGGGAAGUGCGGGCCGGGUCAACUGUCACCGGCUGCA… | 3951 nt | 0.4047 | |
| AGUCGGGCGGGCGGGGAAGUGCGGGCCGGGUCAACUGUCACCGGCUGCA… | 3695 nt | 0.3938 | |
| GCAGUGCGCACGUCAAAGCCGGGCUCGGGCCGCAAGCGGGGCGAGGGGU… | 3829 nt | 0.4186 |
Summary
Enables kinase binding activity and protein serine/threonine kinase activator activity. Involved in intracellular signal transduction; peptidyl-serine phosphorylation; and positive regulation of protein phosphorylation. Located in cytoplasm. Part of serine/threonine protein kinase complex. Implicated in hepatocellular carcinoma. Biomarker of hepatocellular carcinoma and pancreatic cancer. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]
Forensic Context
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