Basic Information

Symbol
ACP1
RNA class
mRNA
Alias
Acid Phosphatase 1 LMW-PTP Low Molecular Weight Phosphotyrosine Protein Phosphatase LMWPTP HAAP Low Molecular Weight Cytosolic Acid Phosphatase Acid Phosphatase Of Erythrocyte Acid Phosphatase 1, Soluble Red Cell Acid Phosphatase 1 Adipocyte Acid Phosphatase LMW-PTPase Cytoplasmic Phosphotyrosyl Protein Phosphatase Testicular Secretory Protein Li 37 Protein Tyrosine Phosphatase Red Cell Acid Phosphatase EC 3.1.3.48 EC 3.1.3.2
Location (GRCh38)
2:264140-279100
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004300.4
Sequence length
1474.0 nt
GC content
0.4179

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-397.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -428.90 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 432.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001040649.3 NCBI
GCCUCUGCGCGCGGGAAGAUGGCGGAACAGGCUACCAAGUCCGUGCUGU… 580 nt 0.4914
NM_004300.4 NCBI
GCCUCUGCGCGCGGGAAGAUGGCGGAACAGGCUACCAAGUCCGUGCUGU… 1474 nt 0.4179
NM_007099.4 NCBI
GCCUCUGCGCGCGGGAAGAUGGCGGAACAGGCUACCAAGUCCGUGCUGU… 1474 nt 0.4118
Summary

The product of this gene belongs to the phosphotyrosine protein phosphatase family of proteins. It functions as an acid phosphatase and a protein tyrosine phosphatase by hydrolyzing protein tyrosine phosphate to protein tyrosine and orthophosphate. This enzyme also hydrolyzes orthophosphoric monoesters to alcohol and orthophosphate. This gene is genetically polymorphic, and three common alleles segregating at the corresponding locus give rise to six phenotypes. Each allele appears to encode at least two electrophoretically different isozymes, Bf and Bs, which are produced in allele-specific ratios. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2008]

Forensic Context

A review of forensic body fluid identification methods notes that acid phosphatase (SAP) serves as the most popular presumptive test for semen, as it catalyzes the hydrolysis of organic phosphates [Virkler & Lednev DOI:10.1016/j.forsciint.2009.02.013]. The method's application is complicated by the presence of vaginal acid phosphatase (VAP), which can cause false positives during analysis.