Basic Information

Symbol
CALM1
RNA class
mRNA
Alias
Calmodulin 1 DD132 PHKD1 CAMI PHKD Calmodulin 1 (Phosphorylase Kinase, Delta) Phosphorylase Kinase Subunit Delta 1 Phosphorylase Kinase Subunit Delta Prepro-Calmodulin 1 Calmodulin-1 CALML2 Phosphorylase Kinase, Delta Subunit Calmodulin-2 Calmodulin-3 CAMIII CPVT4 LQT14 CAM2 CAM3 CAMB CAMC CALM CAM1 CaM CAM
Location (GRCh38)
14:90396502-90408268
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006888.6
Sequence length
4203.0 nt
GC content
0.4325

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1217.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1300.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1182.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001363669.2 NCBI
AGCUGAAGGAGUGUGGCCAAUCUGCCUCCACCUCCCCGCGGACCCCCUA… 4155 nt 0.4270
NM_001363670.2 NCBI
AGAGACGCAAAGUUUCUGCUCCGGGAGGAGGCGGCGGCGCCGCGGGCUC… 4919 nt 0.4446
NM_006888.6 NCBI
GGCAGUGGUGCUGGGAGUGUCGUGGACGCCGUGCCGUUACUCGUAGUCA… 4203 nt 0.4325
Summary

This gene encodes one of three calmodulin proteins which are members of the EF-hand calcium-binding protein family. Calcium-induced activation of calmodulin regulates and modulates the function of cardiac ion channels. Two pseudogenes have been identified on chromosome 7 and X. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.A missense mutation in the CALM1 gene has been associated with ventricular tachycardia.[provided by RefSeq, May 2020]

Forensic Context

A study in Sprague-Dawley rats demonstrated that the CALM1 is crucial for neuronal movement and is associated with the gene PCP4, which exhibited a biphasic upregulation at 3 and 7 days post-tibial fracture and downregulation at 14 days post-fracture in the spinal cord [Deng et al. DOI:10.1038/s41598-025-17561-6].