Basic Information

Symbol
CAMK2N1
RNA class
mRNA
Alias
Calcium/Calmodulin Dependent Protein Kinase II Inhibitor 1 CaMKIINalpha Calcium/Calmodulin-Dependent Protein Kinase II Inhibitor 1 CaMKII Inhibitory Protein Alpha CaMKIIN-Alpha PRO1489
Location (GRCh38)
1:20482391-20486210
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018584.6
Sequence length
2326.0 nt
GC content
0.5206

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-732.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -781.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 507.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_018584.6 NCBI
AUUUCUCCUCGCAGCUCGCUGCCUCCUCUAUCCCUGCCUCCCUCUCCCC… 2326 nt 0.5206
Summary

Predicted to enable calcium-dependent protein kinase inhibitor activity and protein kinase binding activity. Predicted to be involved in long-term memory and positive regulation of inflammatory response. Predicted to be located in neuronal cell body and synapse. Implicated in ovarian cancer; ovarian carcinoma; and prostate adenocarcinoma. Biomarker of hepatocellular carcinoma; oral squamous cell carcinoma; papillary thyroid carcinoma; and prostate cancer. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CAMK2N1 was downregulated in the neocortex and corpus callosum-external capsule at 7 days post-injury following controlled cortical impact, as part of transcriptional responses to traumatic brain injury [Kounelis-Wuillaume et al. DOI:10.1177/08977151251390528].