Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_018584.6
Sequence Length
2326 nt
GC Content
0.5206
AUUUCUCCUCGCAGCUCGCUGCCUCCUCUAUCCCUGCCUCCCUCUCCCCCCUCUGUUUUUCUCCCUUCCUUCCCUCUCCGACCCUCUUCCUCUCCCUCCCGAUCCUUUCCCUCCUCCUCUCAUCUUUCCCCUGUCUCUCCGUUCUAGCUCGUCCCCCACCCCACCUUUUCUUCUUUCUCCUCCUCUCCUUCCUCUCCCCCUCUCCUCUGUCUCCUUCCACCGUCUCCCCUGCCUCCCUGUCUUUCAGUCCCUGUUUUUCAGCCCCGUCUCCCUCUCGGUUUCUCUCCCCCACCCUCCCUCCGGGUUUCCUCCCCGGUGCCCUCCCUCCUCUCUCCCUCCCCUCCCCCUCCGCCCCUCGCAGCCCCGCCGCUCGCAGCUCCCAGUCUGCCUCCCCGAACCGGCGCCGCCGCCCGCACUCGCCGCAGGACCGGCCCGCCCGGCUCCCGGGGUGCGCCCUCCUCGGUCCCGCGCCCUCCGGGCUCGCAGGGACGUCUCCUCCCUCCCGGCUCGCGGCCCCGCCCGGCCCGGCCCCCGCCCAGAGCCCCAGCGCGCCGAGGAUGUGAGUCCUGCUCGCCUCUGGCGGAGCAGCAGCCACUCGCGCGCGGAGCCGGAGCGCAGCGCAGCGCAGCCGCGGGCGCUCUCCGGGCCGCUCGCGCGAGUGCCGCGCUCUUGCCCUAGCGGCGUCCCCCGGCCUCUCGCCGGCGCCACCGCCGCAGCAGCCCGCGGGCCGUCCCCGGCCGGCCGCCCCCGGCCCCAGCGCCGCUGACCCUGUCCGCCGCGGGCGGGGACGCGGGCGGAGGAGGCGCCGCGGCGGAGCCCCCGGACGCGACCAUGUCGGAGGUGCUGCCCUACGGCGACGAGAAGCUGAGCCCCUACGGCGACGGCGGCGACGUGGGCCAGAUCUUCUCCUGCCGCCUGCAGGACACCAACAACUUCUUCGGCGCCGGGCAGAACAAGCGGCCGCCCAAGCUGGGCCAGAUCGGCCGGAGCAAGCGGGUUGUUAUUGAAGAUGAUAGGAUUGAUGACGUGCUGAAAAAUAUGACCGACAAGGCACCUCCUGGUGUCUAACUCCCCCAAAGACAAUGAGUUAAGGGAGAGAAUAAGAACGGCGGUAACAGUUAUUGGCAAAAAGCAUGAAAAGAGAAAGCACUUUGAAAUUUAUUACUAGCUUGCUACCCACGAUGAAAUCAACAACCUGUAUCUGGUAUCAGGCCGGGAGACAGAUGAGGCGAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGAAGGCUCUGGGCUCCUCUGCAAAAAUAAAAAUAAAAAAAUAAAUAAAAUUUUAAAAAUAAUAAAAAUUCACUAUAUACACAUAUAAAGAAAUAAAAAGAAGUCUCAGUUGCAGCUAUUUGUCAAAAUUAAUAUCCAUUUCUUUUUAUAUACGGUGAAUAUUGCGCAAUUAUAGAUCUGGAUUUUGAACCACUUAAUGAAGCGGCAACACCAGGUGUUUUGAGGUGUUGGCAUUCUUCGCUGAUUUGGCUGUUCCCAAUGUUUACAUUAUUUAAUCUUGCAAAAAUGGUUCUGUGCACUUGGAUGUGAAAUGCUGUCCAGUUUUAUUUUUUUUAUGUUGUUAUCCUUGGAUGUACAAAAAAUUCAGAAAAUGAUCUCUGUAGAUAUUCUGUUUUAUUUUGGUCAUCUUUAGAAGUUAUCAGGAAUGUGUUUAAAACAAGAAGAGAACUUUUCUAAGGAAUGAUACAUAGAAAAGAUUUUAUUUUAAAAUGAGUUGUAAAGCUUGUGUUUCUUUGUUGCUGCAAGCUAUCUGCCCAAGUUAAUGCAAAUGGACACAUUUUUUAUGUCAGAAAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACGAAAAACAAAGAAAAAAAUGCUUGAGCUUUUUCUAACUUCCCCUUGCAGUCUGUUGUGUGAGCAGCCUGUUUAUUUCUCUAAUAUUAUGUCAGUUUAUUCUCUUUAAUGGACUGUAAAAAAAUGUAAUCACAAGAGUGCCAAAUAUCUUGAAAUGCCAAAAGGCAUUUUAGUUUCUUUUCUCUGUGCUCUGAGUCCACGUACAGGAAUGCUUGGAGUGUCUUUUCUGUUAUUUAUAGGGAUUCUCUUAAGGCACACCAGCUGCCUGUUUUGCAUGGUAUUUGCAAAAAUGCCUCUUGCGUGAGGAAAUCUUUUACCAUUUUUUGUUUGCAACUUUGGACCUCAAGAGGUUUCCCUUCCCUUCCCCGUUCCCUCUUUUCUUAAUUCAAUAUUCUGUAUGUUGCACCUUGAACCAGCACACAGGGCUAUUUCUCCAAUGUACAAUAAAAGAAUUGUUCCUGUGUCUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-732.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -781.01
Frequency: 0.0000
Diversity: 507.58
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((((((((((...(((((.....(((((((.............................................................((.((.(((((.((((((((((....................((........)).........................(((((((((((...((((...........((((((((((.((.(((((((((((..(((..((((((((.(((..(((((((((((..(((((((((.(((.((((........((((.(.((((..((((.((.(((((((((..............................(((((((((.(((.(((((....(((((.(..(((.(((((((((..((.(((((.((((((((....((((..((((.(((((((..((((.((((((.(((((.(((((((...(((((.....(((((((((((((.......)))))...(((.((.((((......)))))))))...))...))))))..)))))))))))).((((((...))))))((..((((((((.((.((.((((((((((((..((((((...(((((..(((....))).))))))))))).))))..)))))))))).)))))).))))..)).))))).))))))......(((((((....)))))..)))))).))))))))))).)))).(((((....))))).((((...))))............)))))))))).))).))))).))))))((((.(((((.(((.(((.(((......)))))).))).)))))...)))))))..).)))))........)))))..))).)))).).)))).........((((((.....))))))................))))))))).))...))))(((((((((...)))))......))))))))...).)))).......)))).))).)))...)).)))).))))))))))).))).))..(((((((....)))))))..........))))))..)))...)))).)))).......))).))............((.....))......((((......))))..............(((((.((((...((((..............)))).)))).))))).)))))))))).)))).))))))))))))))))))))).))))).)).))((......))...................((((......)))).((((((((....(((..(((((....)))))..)))((((((((((((....((((.....((((....))))))))....))))))))))))....((((....((((((..((((..(..(((........)))..).)))).)).)))))))).(((((((((((((((((((((((((.(.(((((.((((((((..((((....))))......(((.(((((((((((((..(((((((((..(((((((........)))))))(((((((((((.((((((((((((((..(((((((..(((((....((((....)))).)))))..)).)))))..))))...(((((((.((.....(((.......)))....)).))))))).))))).))))))))))))))))((((((...)))))).....(((.(((((((((.........)).)))))))...)))))))))....)))...)))).))))))...))).))).......................(((((.(((.((.((..........(((((((...((....)))))))))..........))..)).))))))))))))))))..............(((((.(..(((((((((......)))))))))..)...)))))))))))))))))))).))))))))))))))))((((((((((((((......(((.((((((..((....)).)))))))))...)))))))))))))).)))))))).))))))).......)))))....)))))).......(((.(((((((....)))))))...)))..)))))........((.(((((((..(((..((.(((((....((((((.....................))))))..........((((((((((.(((((..........))))).)))))).))))..))))).)).)))..))))))).))............
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....{((((((((((.{.(((((.....(((((((..................{,,,,,...................{{.,,....{,{{,.,,,{{.,,,{{{.,.(((((((((({{.{{{{....{(({{{{.{((.........,...............,,{{..(((((((,{,,{{,.,,,{{,.....,,.,.,,,((((((,,({(,.,,,(((((({(,.(((..((((((({.(((..(((((((((((..(((((((((.(((.((((........((((.{.(((({{{{{{.((.(((((((((...........................,..(((({((((.(((.((((({{{,(((((.,..(((.(((((((((..((.(((((.((((((((....((((..(((,{(((((((..((((.((((((.(((((.(((((((,..{((((.....(((((({.(((((.,.....))))).,.(((.((.((((......)))))))}}...}},..))))))..)))))))))))).((((((...)))))),,..((((((((.((.(,{((((((((((((..((((((...(((((.,(({....))).))))))))))).))))..)))))))))).)))))),,)))..}).))))).))))))......({(((((....))))),.)})))).))))))))))).)))).(((((....))))).{{((...}}}}.,...}},.},.)))))))))).))),))))).))))))((((.(((((.(((.(({{(({......,))))).))).)))))...))))))),.).})))),}}.....}))))..))).)))).).)))).,}......((((((.....))))))................))))))))).))....,,|(((((({{,...}}))),.....)}))))))...).)))).}.....)))).))).)))...)).)))).))))))))))).))).)}..(((((((....))))))).........,))))))..))).,,}))),)))}...,,.,))).))....,,.....)},....,),..}}..,}}}}}}).....,,,............(((((.((((.,.((((............,,)))),)))).))))),))))))))),.)))).)))))))))))))))))))))))))))....))|,......}}...................{,,,.....,}}},.{{{{{{{{....{((..(((((....)))))..))}{(((((((((({....(((({,{,...,|},..,..||,|.....})))))))))))....((((....{{(({{..{{{{,||..{((........))).,},)}}}.)),)))))}}}.(((((((((((((((((((((((((.{.(((((.(((((((,,,(({(,...||||,,,...,...,.,.|||||||,.||{|,|,||||{(({((((((.((((({.,...(((((((((((({,((((((((((((((..(((((((..(((({..,.{(((....)))).)))))..)).)))))..)))},..{((((({.((.....{((.......)))....)).}))))))})))))},))))))))))))))))),{{{{,....,}}}}|{,{{,.(((((({((......,,.},.))))))}....}}.}}}}},..,))),.}))))))))))},},}}},.,,....,,,,.............,,{{{{({({(,{,,,,.{,.......(((((((...((....)))))))))..........}}..)).))))))))))))))))..............{{{{{.{..(((((((((......)))))))))......,}}}})))))})))))))))}}}))))))))))))))((((((((((((((,.....(((.((((((..{{....}}.))))))))).},)))))))))))))).}})))))}.))))))).......)))))....))))))......{(((.(((((((....)))))))...)))}.))))}.........,.,....,,,..{{{{{{..|{{{....{{({((...,.................}}}}},.........,{{{{{.,,,.}}))))},....}},..|{.((((((((.{{.((((...{{.....}}...)))).}).))))))))},..
Back