Basic Information

Symbol
ACSL3
RNA class
mRNA
Alias
Acyl-CoA Synthetase Long Chain Family Member 3 ACS3 PRO2194 FACL3 Fatty-Acid-Coenzyme A Ligase, Long-Chain 3 Long-Chain-Fatty-Acid--CoA Ligase 3 Medium-Chain Acyl-CoA Ligase Acsl3 Long-Chain Acyl-CoA Synthetase 3 Fatty Acid CoA Ligase Acsl3 Arachidonate--CoA Ligase EC 6.2.1.3 LACS 3 LACS3 Lignoceroyl-CoA Synthase EC 6.2.1.15 EC 6.2.1.2
Location (GRCh38)
2:222860942-222944639
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004457.5
Sequence length
5577.0 nt
GC content
0.3744

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1440.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1557.97 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1163.27
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001354158.2 NCBI
AGACGCUGCUGUGGCUGCGCCGGGCUGCGACACUGCAGUUGUCUACGCG… 5518 nt 0.3735
NM_001354159.2 NCBI
AGACGCUGCUGUGGCUGCGCCGGGCUGCGACACUGCAGUUGUCUACGCG… 5411 nt 0.3709
NM_004457.5 NCBI
AGACGCUGCUGUGGCUGCGCCGGGCUGCGACACUGCAGUUGUCUACGCG… 5577 nt 0.3744
NM_203372.3 NCBI
AGACGCUGCUGUGGCUGCGCCGGGCUGCGACACUGCAGUUGUCUACGCG… 5470 nt 0.3718
Summary

The protein encoded by this gene is an isozyme of the long-chain fatty-acid-coenzyme A ligase family. Although differing in substrate specificity, subcellular localization, and tissue distribution, all isozymes of this family convert free long-chain fatty acids into fatty acyl-CoA esters, and thereby play a key role in lipid biosynthesis and fatty acid degradation. This isozyme is highly expressed in brain, and preferentially utilizes myristate, arachidonate, and eicosapentaenoate as substrates. The amino acid sequence of this isozyme is 92% identical to that of rat homolog. Two transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ACSL3 gene expression was significantly up-regulated in liver tissue following combined alcohol and high-fat diet-induced injury, and this dysregulation was effectively reversed by scoparone intervention, indicating its role in perturbed fatty acid metabolism during hepatotoxicity [Wei et al. DOI:10.1016/J.Biopha.2022.113770].