Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_004457.5
Sequence Length
5577 nt
GC Content
0.3744
AGACGCUGCUGUGGCUGCGCCGGGCUGCGACACUGCAGUUGUCUACGCGGCCGGGGCCGGGACGAGGAGGCGUUGGACGGGGUCGCAUACGUUCGUCCCCUCGCAUUGCGGCCCCGACAGCUGCGCCAGGAUCCCCGGGCGGCGGCGCGGGGCGUGAACGCUCUGGGGCUCAGCCAGGCCUGCGCGGGCCCGAGGCCGGAGGAACCCGGACUCCGGCGUAGCGGUUUUGACACAAGGGCGCAUAUCUUCAAAGCACCUAGUACCUCCUACCAUUGUCAACUGAUACAGAAUUCGUUGUUGGGAAGGACUGGGGAAACAGCUGUAACAUUUGCCACCCUCAGAAGCUGCUGGUCCUGUGUCACACCACCUUAGCCUCUUGAUCGAGGAAGAUUCUCGCUGAAGUCUGUUAAUUCUACUUUUUGAGUACUUAUGAAUAACCACGUGUCUUCAAAACCAUCUACCAUGAAGCUAAAACAUACCAUCAACCCUAUUCUUUUAUAUUUUAUACAUUUUCUAAUAUCACUUUAUACUAUUUUAACAUACAUUCCGUUUUAUUUUUUCUCCGAGUCAAGACAAGAAAAAUCAAACCGAAUUAAAGCAAAGCCUGUAAAUUCAAAACCUGAUUCUGCAUACAGAUCUGUUAAUAGUUUGGAUGGUUUGGCUUCAGUAUUAUACCCUGGAUGUGAUACUUUAGAUAAAGUUUUUACAUAUGCAAAAAACAAAUUUAAGAACAAAAGACUCUUGGGAACACGUGAAGUUUUAAAUGAGGAAGAUGAAGUACAACCAAAUGGAAAAAUUUUUAAAAAGGUUAUUCUUGGACAGUAUAAUUGGCUUUCCUAUGAAGAUGUCUUUGUUCGAGCCUUUAAUUUUGGAAAUGGAUUACAGAUGUUGGGUCAGAAACCAAAGACCAACAUCGCCAUCUUCUGUGAGACCAGGGCCGAGUGGAUGAUAGCUGCACAGGCGUGUUUUAUGUAUAAUUUUCAGCUUGUUACAUUAUAUGCCACUCUAGGAGGUCCAGCCAUUGUUCAUGCAUUAAAUGAAACAGAGGUGACCAACAUCAUUACUAGUAAAGAACUCUUACAAACAAAGUUGAAGGAUAUAGUUUCUUUGGUCCCACGCCUGCGGCACAUCAUCACUGUUGAUGGAAAGCCACCGACCUGGUCCGAGUUCCCCAAGGGCAUCAUUGUGCAUACCAUGGCUGCAGUGGAGGCCCUGGGAGCCAAGGCCAGCAUGGAAAACCAACCUCAUAGCAAACCAUUGCCCUCAGAUAUUGCAGUAAUCAUGUACACAAGUGGAUCCACAGGACUUCCAAAGGGAGUCAUGAUCUCACAUAGUAACAUUAUUGCUGGUAUAACUGGGAUGGCAGAAAGGAUUCCAGAACUAGGAGAGGAAGAUGUCUACAUUGGAUAUUUGCCUCUGGCCCAUGUUCUAGAAUUAAGUGCUGAGCUUGUCUGUCUUUCUCACGGAUGCCGCAUUGGUUACUCUUCACCACAGACUUUAGCAGAUCAGUCUUCAAAAAUUAAAAAAGGAAGCAAAGGGGAUACAUCCAUGUUGAAACCAACACUGAUGGCAGCAGUUCCGGAAAUCAUGGAUCGGAUCUACAAAAAUGUCAUGAAUAAAGUCAGUGAAAUGAGUAGUUUUCAACGUAAUCUGUUUAUUCUGGCCUAUAAUUACAAAAUGGAACAGAUUUCAAAAGGACGUAAUACUCCACUGUGCGACAGCUUUGUUUUCCGGAAAGUUCGAAGCUUGCUAGGGGGAAAUAUUCGUCUCCUGUUGUGUGGUGGCGCUCCACUUUCUGCAACCACGCAGCGAUUCAUGAACAUCUGUUUCUGCUGUCCUGUUGGUCAGGGAUACGGGCUCACUGAAUCUGCUGGGGCUGGAACAAUUUCCGAAGUGUGGGACUACAAUACUGGCAGAGUGGGAGCACCAUUAGUUUGCUGUGAAAUCAAAUUAAAAAACUGGGAGGAAGGUGGAUACUUUAAUACUGAUAAGCCACACCCCAGGGGUGAAAUUCUUAUUGGGGGCCAAAGUGUGACAAUGGGGUACUACAAAAAUGAAGCAAAAACAAAAGCUGAUUUCUUUGAAGAUGAAAAUGGACAAAGGUGGCUCUGUACUGGGGAUAUUGGAGAGUUUGAACCCGAUGGAUGCUUAAAGAUUAUUGAUCGUAAAAAGGACCUUGUAAAACUACAGGCAGGGGAAUAUGUUUCUCUUGGGAAAGUAGAGGCAGCUUUGAAGAAUCUUCCACUAGUAGAUAACAUUUGUGCAUAUGCAAACAGUUAUCAUUCUUAUGUCAUUGGAUUUGUUGUGCCAAAUCAAAAGGAACUAACUGAACUAGCUCGAAAGAAAGGACUUAAAGGGACUUGGGAGGAGCUGUGUAACAGUUGUGAAAUGGAAAAUGAGGUACUUAAAGUGCUUUCCGAAGCUGCUAUUUCAGCAAGUCUGGAAAAGUUUGAAAUUCCAGUAAAAAUUCGUUUGAGUCCUGAACCGUGGACCCCUGAAACUGGUCUGGUGACAGAUGCCUUCAAGCUGAAACGCAAAGAGCUUAAAACACAUUACCAGGCGGACAUUGAGCGAAUGUAUGGAAGAAAAUAAUUAUUCUCUUCUGGCAUCAGUUUGCUACAGUGAGCUCAGAUCAAAUAGGAAAAUACUUGAAAUGCAUGUCUCAAGCUGCAAGGCAAACUCCAUUCCUCAUAUUAAACUAUUACUUCUCAUGACGUCACCAUUUUUAACUGACAGGAUUAGUAAAACAUUAAGACAGCAAACUUGUGUCUGUCUCUUCUUUCAUUUUCCCCGCCACCAACUUACUUUACCACCUAUGACUGUACUUGUCAGUAUGAGAAUUUUUCUGAAUCAUAUUGGGGAAGCAGUGAUUUUAAAACCUCAAGUUUUUAAACAUGAUUUAUAUGUUCUGUAUAAUGUUCAGUUUGUAACUUUUUAAAAGUUUGGAUGUAUAGAGGGAUAAAUAGGAAAUAUAAGAAUUGGUUAUUUGGGGGCUUUUUUACUUACUGUAUUUAAAAAUACAAGGGUAUUGAUAUGAAAUUAUGUAAAUUUCAAAUGCUUAUGAAUCAAAUCAUUGUUGAACAAAAGAUUUGUUGCUGUGUAAUUAUUGUCUUGUAUGCAUUUGAGAGAAAUAAAUAUACCCAUACUUAUGUUUUAAGAAGUUGAGAUCUUGUGAAUAUAUGCCUGUCAGUGUCUUCUUUAUAUAUUUAUUUUUUAUUAGAAAAAAUGAAGUUUGGUUGGUGAUGCAUGAAACAAAAUAGCAAGAGAGGGUUAUAGUUUAAUAGUAAGGGAGAUAACACAGCAUGUGUAGCACCAGUUGAUAAUUGGUCUCUAGUAGCUUACUGUCAAAAUGUUCAAUGAAGUCUUCUGUUCAUCUGUUGAAACUAGGAAAAUACCCAAACUUAAAUGGAAGAAUUCUGAAAGAGAGGAUAGAAUUUAAAGAACAAGAGUAUAUAAAGUUAUUCUUUGAAUAUUUCGUUGACUAUAUGUACAUUGAGUUAUCUAUAUUUGUAAACAAAUUAGUCAUGGAAAAUUAUUCUAUCUCAAAGUCUCCUUUUAGUCUAGAUAAUCAUUAUUUCAUUUUAAAAUUAGUGUUUUUCCUAGUUUGCACUGAUGCGUGUAUGGAUGUGUGUGAGUCAGUGGUAGCUUAUUUAAAAAGCACCUUAUCCUUUCUCCCAUAACCUUUGUACACUAAAAAAUGAAAGAAUUUAGAAUGUAUUUGAUGAUAGCAUUCUCACUAAGACACAUGAGAAUUUAACUUUAUAACCGCGUGAGUUAAGAUUUAAUUCAUAGGUUUUGAUGUCAUUGUUGAAGUUAUUUGUAAUUCAGAAACCUUGCUUGUGUGAUACAUAGUCUCUUCAUUUAUUACUGCUUGUCUGUUGUUAUAUCUGGAUUAUCAAAAGCAAUAGUGCACCAAUUAAGAUGUGCUCAAAUCAGGACUUAAAUCAUAGGCACCACAUUUUUCAUGUCAGACUAGUUACUUUGUUGAUUCUCAGUUACUGUAGGCAUCAAAAGGCAAAAAUCAAAAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAGAUGAACCUAGGUCUGUGUAAAGUAAGGGGAGUGUUAGGAGCAGCCAGGACUGUGUAGUGUGUGUUUGGUUGCAUCACAAACAUCGUAUGUGGAGACAUUGCAAUACAGUGUUUUUUGUUUUCAACUUUUCUUGUAUUGUAUAUUUGUAUUAUGUUUUGAAUGCUUUUCUCUUUUCAUAAUUAAAUAUUAAUGUUUGGGAUAACUGCCAAGAAGAAGUAAAAAUAUUGAAUGGAACUUCUAUAUGAGGAUGCUGUGAUCUAAAAAUUAAAUCUCAGUGGGCGGAGAGAAUUUGUUUCUGAUGCCUUGUCUUUAGAAUAAUUGUUUGCUUUCAGAUGAUUAAAAAAAGGAGAUUGUAUCUAGGAAAAAAGUGUGAAUGCUUCAAAGGAGAGAUACUGAUAAUUGUGACUUGAAAUAGUGUCAGAUGAAUUAUGUAGCUGAUCACUGAUGGAACCAUCUAAUGAGGCAGGCUUAAACUCUAUUUAGUUUCGUUUGUUUUCUCAUAUGAAGUUUAUAAUUCCUUUCAGUCCUAAAAUGUCAGAUGCCAGGUGUCAAAUGCCACAGUAGAAAGUGAAAUUAAGUAGAGUCCCCUUUUAAACAAAUUUGUCUGUAAGCAAAACUAUCUUUAGUGACUUAAAAAAUAAUAUCCUCUAAAAUUACCCUUUCAAGAGGAAAAAACUGUUCAAUGAAAAAACCACUCAAUUAUGACUCAUAUAAGAAAUACUGGUUUAACCAGGAGAUAUUUGGGGAGCAAAAUUUUAAGGAAUUUCAAAUUGCUAAAUCUAAUACAAAUAUCUGACAAUAAGAUACAGAUCUAAAAGAAUGGUUCUUAAGAACUAUUGUUUACUGGGAAUAAACUAAGCUCUAUGAAGAAUUCGUAAGCAUUACAUGUUCCAGUAAGUUUAGCAACUUAGAGCCAAGACUGGUGGCCACCUCCAUUUAUUUCCCC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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1440.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1557.97
Frequency: 0.0000
Diversity: 1163.27
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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