Basic Information

Symbol
CAPN11
RNA class
mRNA
Alias
Calpain 11 Calcium-Activated Neutral Proteinase 11 Calpain-11 CANP 11 EC 3.4.22.54 EC 3.4.22.52 EC 3.4.22.- Calpain11 EC 3.4.22
Location (GRCh38)
6:44158811-44184401
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_007058.4
Sequence length
2718.0 nt
GC content
0.5456

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1037.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1083.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 645.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_007058.4 NCBI
AACUGUCAAGCACCGAGCUAGCCACCAGCAUGCUGUACUCCCCAGGGCC… 2718 nt 0.5456
Summary

Calpains constitute a family of intracellular calcium-dependent cysteine proteases. There are eight members in this superfamily. They consist of a variable 80 kDa subunit and an invariant 30 kDa subunit. This calpain protein appears to have protease activity and calcium-binding ability. A similar mouse protein may play a functional role in spermatogenesis and in the regulation of calcium-dependent signal transduction events during meiosis. [provided by RefSeq, Dec 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CAPN11 level significantly increased in the cerebral cortex during the early post-mortem interval (0-32 hours), establishing its role as a protein marker for PMI estimation [He et al. DOI:10.1007/s00414-025-03625-9].