Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_007058.4
Sequence Length
2718 nt
GC Content
0.5456
AACUGUCAAGCACCGAGCUAGCCACCAGCAUGCUGUACUCCCCAGGGCCGAGUCUUCCGGAGUCAGCAGAGAGCCUGGAUGGAUCACAGGAGGAUAAGCCUCGGGGCUCAUGUGCGGAGCCCACUUUUACUGAUACGGGAAUGGUGGCUCACAUAAACAACAGCCGGCUCAAGGCCAAGGGCGUGGGCCAGCACGACAACGCCCAGAACUUUGGUAACCAGAGCUUUGAGGAGCUGCGAGCAGCCUGUCUAAGAAAGGGGGAGCUCUUCGAGGACCCCUUAUUCCCUGCUGAACCCAGCUCACUGGGCUUCAAGGACCUGGGCCCCAACUCCAAAAAUGUGCAGAACAUCUCCUGGCAGCGGCCCAAGGAUAUCAUAAACAACCCUCUAUUCAUCAUGGAUGGGAUUUCUCCAACAGACAUCUGCCAGGGGAUCCUCGGGGACUGCUGGCUGCUGGCUGCCAUCGGCUCCCUUACCACCUGCCCCAAACUGCUAUACCGCGUGGUGCCCAGAGGACAGAGCUUCAAGAAAAACUAUGCUGGCAUCUUCCAUUUUCAGAUUUGGCAGUUUGGACAGUGGGUGAACGUGGUGGUAGAUGACCGGCUGCCCACAAAGAAUGACAAGCUGGUGUUUGUGCACUCAACCGAACGCAGUGAGUUCUGGAGUGCCCUGCUGGAGAAGGCGUAUGCCAAGCUGAGUGGGUCCUAUGAAGCAUUGUCAGGGGGCAGUACCAUGGAGGGCCUUGAGGACUUCACAGGAGGCGUGGCCCAGAGCUUCCAACUCCAGAGGCCCCCUCAGAACCUGCUCAGGCUCCUUAGGAAGGCCGUGGAGCGAUCCUCCCUCAUGGGUUGCUCCAUUGAAGUCACCAGUGAUAGUGAACUGGAAUCCAUGACUGACAAGAUGCUGGUGAGAGGGCACGCUUACUCUGUGACUGGCCUUCAGGAUGUCCACUACAGAGGCAAAAUGGAAACACUGAUUCGGGUCCGGAAUCCCUGGGGCCGGAUUGAGUGGAAUGGAGCUUGGAGUGACAGUGCCAGGGAGUGGGAAGAGGUGGCCUCAGACAUCCAGAUGCAGCUGCUGCACAAGACGGAGGACGGGGAGUUCUGGAUGUCCUACCAAGAUUUCCUGAACAACUUCACGCUCCUGGAGAUCUGCAACCUCACGCCUGAUACACUCUCUGGGGACUACAAGAGCUACUGGCACACCACCUUCUACGAGGGCAGCUGGCGCAGAGGCAGCUCCGCAGGGGGCUGCAGGAACCACCCUGGCACGUUCUGGACCAACCCCCAGUUUAAGAUCUCUCUUCCUGAGGGGGAUGACCCAGAGGAUGACGCAGAGGGCAAUGUUGUGGUCUGCACCUGCCUGGUGGCCCUAAUGCAGAAGAACUGGCGGCAUGCACGGCAGCAGGGAGCCCAGCUGCAGACCAUUGGCUUUGUCCUCUACGCGGUCCCAAAAGAGUUUCAGAACAUUCAGGAUGUCCACUUGAAGAAGGAAUUCUUCACGAAGUAUCAGGACCACGGCUUCUCAGAGAUCUUCACCAACUCACGGGAGGUGAGCAGCCAACUCCGGCUGCCUCCGGGGGAAUAUAUCAUUAUUCCCUCCACCUUUGAGCCACACAGAGAUGCUGACUUCCUGCUUCGGGUCUUCACCGAGAAGCACAGCGAGUCAUGGGAAUUGGAUGAAGUCAACUAUGCUGAGCAACUCCAAGAGGAAAAGGUCUCUGAGGAUGACAUGGACCAGGACUUCCUACAUUUGUUUAAGAUAGUGGCAGGAGAGGGCAAGGAGAUAGGGGUGUAUGAGCUCCAGAGGCUGCUCAACAGGAUGGCCAUCAAAUUCAAAAGCUUCAAGACCAAGGGCUUUGGCCUGGAUGCUUGCCGCUGCAUGAUCAACCUCAUGGAUAAAGAUGGCUCUGGCAAGCUGGGGCUUCUAGAGUUCAAGAUCCUGUGGAAAAAACUCAAGAAAUGGAUGGACAUCUUCAGAGAGUGUGACCAGGACCAUUCAGGCACCUUGAACUCCUAUGAGAUGCGCCUGGUUAUUGAGAAAGCAGGCAUCAAGCUGAACAACAAGGUAAUGCAGGUCCUGGUGGCCAGGUAUGCAGAUGAUGACCUGAUCAUAGACUUUGACAGCUUCAUCAGCUGUUUCCUGAGGCUAAAGACCAUGUUCACAUUCUUUCUAACCAUGGACCCCAAGAAUACUGGCCAUAUUUGCUUGAGCCUGGAACAGUGGCUGCAGAUGACCAUGUGGGGAUAGAGGCGCUGUAGGAGCCUGGUCAUCUCUACCAGCAGCAGCAGCAGCGAGGUUCUAGCCCAGGAGGGUGGGGUGCUUCUUGUAGCCCUCAGCUCUCCGGUCUCUGCUGAUGAAAUGGGCUCCAGGUGGCAGUGCCCGGGUCCCAGGUGCCGUGUUUACUGCAGCAGUGGGACCUCCGUGCCCACUCCCCCAGCUCAGAGGCUUUCUCUUUUUUCCCCAACCCGGCUUCUGAUGGCUGGCUUUCCCCCACCAUCGCUCUCUCAGAGUAUAUUUUACUAAAGAGUAGUUGAUGCUUCCCCAGGGUCCCCCUGGCUGGGGAGGCCAAGAAUAGGGAAGGGACUUGUAGCCCGUUUCUUACCCUCCAUGCUUGCUGUCCUGCUCACACCUACCUGCUGACCACCCAUCCUGGCACAGCCUCUGUUUUCCUCCCCAUCUGUGGAUACUAUUCUAAUAAAUAGCACAUGCCAUUGGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1037.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1083.42
Frequency: 0.0000
Diversity: 645.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........(((.....))).((((...((((((((.(((((..(((((...)))))..))))))))(((((.(((.((((((.((((((((((.........((((((((.((.(((((((((.............(((((((.((((((((..........(((((((...))))...))))))))))).)..((((...((((((.((((((...)))))).)))).)).((((....)))).))))......((((((..(((...)))..)))))))))))).((((....))))....))))))))..).)).))))))))(((((.....((((((.((..((((((((((((..((....(((............((((((((.....))))).))).....)))....).)..))))))))))))..))((((((((.((((........)))).))).)))))...(((((((.(((((((((((..(((((((((.....((((......)))).......))))))).)).((((.........)))).)))))))))))...)))))))..((.((((((.(.((.((((((((((..........((((((....))))))((((((....((((.......))))..))))))((....))((((((.((.(((((((((.....((((((.....(((((((((...(((((......((.(((((((..(((.((....((((((..........)))))))).))).))))))))).......)))))((((((((....(((((((((((((((((((........))))))))))))...((((((.(((((..(((..((.....(((..(((....)).)..)))....))..)))..)))))..)))))))))))))....(((((......).)))).........(((((((((((.(((((.....))))).))))))).))))....))))))))...)))))))))(((((((((.....(((((....((((..(((((.(((((...)))))..((.((((((.(((((((((.(((........))).))))))))).....)))).)))).)))))..))))........)))))....))))))))))))))).....))))..))))).))..))))))....)))))))))))))....((((((((....))))))))....)))))).))))))))(((((..((.(((((.....((((....)))).....))))).))..)))))((((..((.(((((((((.((.((((((((((.(((((((.((.((...((((.............))))....)))).)))).....))).))))))))))..)).))))))))).))..)))).....)))))...(((((...((((.((((((((((((((....)))))))...)))....((.(((.(..((((((((((((((..((..((((...((((((.((((((......))))))....(((((((((......)))))))))))))))))))((.((..((..(((((......((((((.(((....)))..)))))))))))..)).))))..(((((.....(((.......))).....)))))..))..))))))))))))))...).))).)).)))).)))).....)))))......(((((((((.((((((.((((...(((((......))))).(((((((.((.....))))))).)).........(((....(((((..(((((..(((((.(.((((.((.(((((.((.....((.((.((((...((..(((((((.((((....)))))))))))))...)))))).))...........((((((......))).)))..((((.(((((((((....((((((...))))))((((((((....((((((((((((((......(((((.((((((..........((((.....((((((((((((((((...((((.((((((.(((.(((.......))))))..)))))).))))..)))..))))(((((..(((....))))))))...)))).))))).......))))..........)))))))))))...))))))))....((..((....))..))..)))))))))))))))))))))))))))..))))))).)))))).).)))))..))))).(((((((((((.(((......)))))))).)))))))))))..)))...((((((((((.(((((((((.((...(((((((((.(((.((....)).))).)..)))))))).)))))).......((((((((((((((....................)))))))))..)))))(((((((.....((((((((((...((((.....))))..)))).)).))))((((((((((...........))))))))))........))))))).))))).)))))))))).....)))).))))..)).)))))).))).))).)))).)))....)))))).))).....)))))...(((...........)))..(((((......)))))..)))))...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{{{{((({....((({,((({((({.(((((.(((((..(((((...)))))..))))))))))..,,|{||}|,}||{{{.,....,}}}.{{||||{|((({{{((((..((({{{(((.{..(((...)))..}.)))))))).},,........{{.((((({,|(((..{|||.|||||,.,,.......})||||,..((((((...)))))){||||,||{|{|,{{{{{{{(((.{{,.....,}},{{|||||,,,}}|,((((((..{({(,((((((((((((....))))).)))}.,,.((((((((....{{(((...((((.....))))....))).}).))))),,)).............((((((((.....))))).)))..{(((((....({{(((((((((((|.((((.(((({(((.((((.,......)))).))),))))|{{,(((((((,(((((((((((..{{(((((((..,..((((......))))..,....))))))),||.,,,,.|,......,},,.)))))))))))...}}})))}..,,.}}}})),}.|{.((((((((((..........((((((....))))))((((((....((((.......))))..))))))((....))((((((.((.(((((((((..,,.((((((.....(((((((((..,(((((......((.(((((((..(((.{{....((((((.{......,.))))))}}.))).))))))))).......))))|((((((((....(((((((((((((((((((........))))))))))))...((((((.(((((..(((..((.....(((..{((....)).}..))),...))..)))..)))))..)))))))))))))....{{(((,.....,.}}},.........(((((((((((.(((((.....))))).))))))).))))....)))))))}...)))))))))(((((((((,...{(((({{...((((..(((((.{((((...))))}...{.{(((({.(((((((((.(((........))).))))))))).....)))).})}},)))))..))))...}},}.,,))}....))))))))))))))).,...))))..))))).)}..))))))....))))))))))},,....((((((((....))))))))))))..,.)))))))}...(((((..((.((((({{...((((....)))).}},.))))}.))..)))))((((..((.(((((((((.((,((((((((((.(((((((,(,,((,,.,(((.,......|..|.}}}},,..)))).)))),.,,,))).)))))))))).,)).))))))))).))..)))).....{{{{.....,,,}}}}.|}}}}}},...(((((((....))))))).(({{{.{{.((.(((.{.{((((((((((((((..((..(((,..{{{{|||.((((((......)))))),,}}(((((((((......)))))))))|,,||{||,,.....}}}}}.||,((((({.,((((((.(({....}))..)))))},}).)))))},}}}..{(({{....,{{{.....,,)}}.,...)))},..))..)))))))))))))).}.).))).)).)))))))||{{{{{{.....}))).))))..)))))))))).))}}.,)))))).},}))))))).})))))||||{,{(({(((((((,,..,{{{...,{{,.,,,,.{{..{{{{,..,))})}}..((((((((,,{({(,,....{{.,,,)}.....,}},))..))))))))|{|||||(((.(((((.....(((...)))...})))).))),((((.((({........((((((((((((((((((.,.((...((((((..,{{....,,|{{..(((((.((.......)).))))),}}.....,.....))))))..))..))))))))|(((((((.,.((((.((((((.(((.(((.......))))))..)))))).)))).,)))..)))),..........}))))))))))))).))))|}.}}))}.},,,..))))))).,}}),)))))),{((((.((({.(((((((((.....(.((((((((((((..(((((((,..((((((.,......(((((((((((((,.((((....{{{({.(((((((((((.(((......)))))))}|)))))))).....))))}.((((((((((.((((((({(,{(,..((((((((,.(((.((....}}.))),),.)))))))).,}}))},,,,.,.((((((((((((((....................))))))))}.,)))))(((((((....,((((((((((...((((.....))))..)))).))},))){((((((((({{...,}}...})))))))))........))))))).))))).))))))))))....)))),.)))}})))),.)))))...........).))))))..,.))))}}))..)))))))))}))).,..))))))))).}))).))))}.....}))).,.)))..}))))
Back