Basic Information

Symbol
CASD1
RNA class
mRNA
Alias
CAS1 Domain Sialic Acid O Acetyltransferase 1 C7orf12 CAS1 Domain Containing 1 Cas1 N-Acetylneuraminate (7)9-O-Acetyltransferase CAS1 Domain-Containing Protein 1 Sialate O-Acetyltransferase Capsule Synthesis 1 FLJ21213 FLJ21879 Cas1p SOAT N-Acetylneuraminate 9-O-Acetyltransferase Chromosome 7 Open Reading Frame 12 O-Acetyltransferase WUGSC:H_GS542D18.2 CAS1 Protein EC 2.3.1.45 NBLA04196
Location (GRCh38)
7:94509219-94557302
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022900.5
Sequence length
3931.0 nt
GC content
0.3839

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1048.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1132.41 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 986.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001363426.1 NCBI
GAGACAGGCGUCCAGGGCGCCUGGGGAACCGGCACGGCGGAGCAGCGGC… 4124 nt 0.3882
NM_001363427.1 NCBI
GAGACAGGCGUCCAGGGCGCCUGGGGAACCGGCACGGCGGAGCAGCGGC… 3912 nt 0.3908
NM_001363428.1 NCBI
GAGACAGGCGUCCAGGGCGCCUGGGGAACCGGCACGGCGGAGCAGCGGC… 3947 nt 0.3836
NM_022900.5 NCBI
GAGACAGGCGUCCAGGGCGCCUGGGGAACCGGCACGGCGGAGCAGCGGC… 3931 nt 0.3839
Summary

Enables N-acetylneuraminate 9-O-acetyltransferase activity. Involved in carbohydrate metabolic process. Located in Golgi membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CASD1 transcript, a CRISPR-associated endonuclease involved in immune regulation, increased in relative abundance within one hour postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].