Basic Information
Symbol
CAV1
RNA class
mRNA
Alias
Caveolin 1
Caveolin 1, Caveolae Protein, 22kDa
Caveolin-1
CAV
Caveolin 1, Caveolae Protein, 22kD
Cell Growth-Inhibiting Protein 32
MSTP085
BSCL3
LCCNS
VIP21
CGL3
PPH3
Location (GRCh38)
7:116524994-116561179
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation
MANE select
Transcript ID
NM_001753.5
Sequence length
2456.0 nt
GC content
0.4088
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-655.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-700.42 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
794.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| UAAAGCACAGCCCAGGGAAACCUCCUCACAGUUUUCAUCCAGCCACGGG… | 3212 nt | 0.4605 | |
| GUGCACGGAGCCGUAGCUGUCGGAGCGGUUAGUUCGAUUUCGAGCUCGA… | 2562 nt | 0.4192 | |
| GUGCACGGAGCCGUAGCUGUCGGAGCGGGACAUCUCUACACCGUUCCCA… | 2426 nt | 0.4085 | |
| ACAGUUUUCAUCCAGCCACGGGCCAGCAUGUCUGGGGGCAAAUACGUAG… | 2456 nt | 0.4088 |
Summary
The scaffolding protein encoded by this gene is the main component of the caveolae plasma membranes found in most cell types. The protein links integrin subunits to the tyrosine kinase FYN, an initiating step in coupling integrins to the Ras-ERK pathway and promoting cell cycle progression. The gene is a tumor suppressor gene candidate and a negative regulator of the Ras-p42/44 mitogen-activated kinase cascade. Caveolin 1 and caveolin 2 are located next to each other on chromosome 7 and express colocalizing proteins that form a stable hetero-oligomeric complex. Mutations in this gene have been associated with Berardinelli-Seip congenital lipodystrophy. Alternatively spliced transcripts encode alpha and beta isoforms of caveolin 1.[provided by RefSeq, Mar 2010]
Forensic Context
A systematic review of postmortem human brain studies found that the CAV1 mRNA transcript was decreased in the anterior cingulate cortex of individuals who died by suicide compared to controls, indicating altered expression of this connexin-binding partner in glial cells within a brain region implicated in suicidal behavior [Yamamoto et al. DOI:10.3390/Ijms25115750].