Basic Information

Symbol
CCDC124
RNA class
mRNA
Alias
Coiled-Coil Domain Containing 124 Lso2 Oxs1 Coiled-Coil Domain-Containing Protein 124
Location (GRCh38)
19:17932588-17944914
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001136203.2
Sequence length
987.0 nt
GC content
0.6606

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-410.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -425.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 273.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001136203.2 NCBI
GGAGGCGCGACCGGGCCGGCGCUGGGGUAAGAAGCCUGCUGAGGGAUGC… 987 nt 0.6606
NM_138442.4 NCBI
GAGACGGACUCUUGCUAUGUUGCCCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGGCCU… 1049 nt 0.6482
Summary

Enables RNA binding activity. Predicted to be involved in transcription by RNA polymerase II. Located in cytosol and plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in cynomolgus monkeys demonstrated that chronic exposure to methamphetamine or heroin upregulated the CCDC124 in the hippocampus compared to controls, as confirmed by RNA-Seq and RT-qPCR [Choi et al. DOI:10.30773/pi.2022.0004].