Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_138442.4

Sequence Length

1049 nt

GC Content

0.6482

GAGACGGACUCUUGCUAUGUUGCCCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGGCCUCAAGCAAUCCUCCUGCCUCAGCCUCCCAAAGCACGGGGAUUACAAACCCUGCUGAGGGAUGCCCAAGAAGUUCCAGGGUGAGAACACCAAGUCGGCAGCGGCCCGGGCACGUAGGGCAGAGGCCAAGGCGGCCGCUGAUGCCAAGAAGCAGAAGGAGCUGGAGGAUGCCUACUGGAAGGACGACGACAAACACGUCAUGAGGAAGGAGCAGCGCAAGGAGGAGAAGGAGAAGCGGCGCCUCGACCAGCUGGAACGUAAGAAGGAGACGCAGCGCCUACUGGAGGAGGAGGACUCCAAGCUCAAGGGCGGCAAGGCGCCGCGGGUGGCCACGUCCAGCAAGGUCACCCGGGCCCAGAUCGAGGACACGCUGCGCCGAGACCAUCAGCUCAGGGAGGCCCCGGACACAGCCGAGAAAGCCAAGAGCCAUCUGGAGGUGCCGCUGGAGGAGAACGUGAACCGCCGCGUGCUGGAGGAGGGCAGCGUGGAGGCGCGCACCAUCGAGGACGCCAUUGCAGUGCUCAGCGUGGCGGAGGAGGCGGCCGACCGGCACCCAGAAAGACGCAUGCGGGCAGCCUUCACAGCCUUUGAGGAAGCCCAGCUGCCGCGGCUCAAACAAGAGAACCCCAACAUGCGGCUGUCGCAGCUGAAACAGCUGCUCAAGAAGGAGUGGCUCCGCUCUCCUGACAACCCCAUGAACCAGCGGGCCGUGCCCUUCAAUGCCCCCAAGUGAGCCCAGAACUUGGGGAGCCAGUUCACCCACGGGUGGUCCAGGUCACGACUCUGCACGCCCUUAGGCCAGGUCAGCUGCGAGGGUCACAGAGCGUUCCGGGGGCCAAGGCGCCGGGCCCCGGGGCCAUGCUCUUAUCACCAGCCACCCGUCCUCCCGCCAGAGGGUCCCUGCCCCGAGUGACACCCCAUCCCCUCCCAUCCCCCGGCGCGUGUGUGUAGAGCCUCAGGGCUGAGUGCCCAAUAAAGGUGGCGGCAAGGCUGCGGUGAGGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-435.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -451.21

Frequency: 0.0000

Diversity: 216.42

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

........(((((.(((((((.((..((((((((.....(((((..((((..((..(.(((((.(((((((.((((..((((.(((.........)))))))..)))).))((....((((((..((((....))))..((((((.((.(((..(((.(........)..)))..))).)).))))))((......))....))))))...))...(((......)))..((((.......)))).))))).))))).)..))...))))...)))))..((...))...))))))))))))))).)).)))))((((((((((....((((((((.(((......((((..((((((...((.(((.(((((((((..((...))..)))))))))))))).......((((.(.(((.((.(((........))).((((((((((((.(((..((.(((..((.....))..)))))..)))...)))).)).....((((((.((((((((.(((.((..((((((((((((((..((.((...(((.((((....)).)).))).(((((.((.....((..(((....)))..)).......))))))))))).))))))))..(((...))).......))))))....(((......)))..))))).))))))))....(((((((...)))))))....(((((.(((((.(((((.((.((.......)).))...))))))))..)))))))...((((((((((.........)))))))).))..))))))..(((((((((...(((...(((((((((.(((((......)))...))))).))))))..((((((((((((((.((........)).)))))))))...)))))....))).)))))))))))))))))))).).)))))))))).)))).........))))))))..)))...))))).))))).....((((((((((.....))))..........(((((...)))))..)))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

........(((((.(((((((.,({{((((((((..,..(((((..((((..((..{,(((({.(((({((.((((..((((.(((.........)))))))..)))).)){{....{(((((..((((....))))..,(((((.((.(((..(((.(......,.,.,)))..))).)).))))}|((......)),...))))))},,)),,,|({...,..}}}.,((((.......)))).))))).))))).,..}}...||||.,.}|}}}..,|..,,)}}})))))))))))))))},).}))))((((((((((....((((((((.(((......((((..((((((...((.(((.(((((((((..,,...},..)))))))))))))).......(({{.{.(((.((.(((.......,)}).((({(((({(((.(((..((.(((..((.....))..)))))..)))}}}||||.||.,...((((((.((((((((.(((.((.{((({(({(({.{{{||||.{{.{{{{{,.((({{,,||.,,.,,}.}|||||||,.{{,(({,(((..,.,||..|}.....,..}}..}}|}|}.}))}}}.,..,},,}))))..)))).)))))),},.(((......)))..))))).)))))))).,..(((((((...)))))))....(((((.(((((.(((((.((.((.......)).))...)))))))),.,})))))...((((((((((.........)))))))).))..))))))..(((((((((...(((...(((((((((.(((((......)))...))))).))))))..((((((((((((((.((........)).)))))))))...)))))....))).))))))))))))))}))))).},)))))))))).)))).........))))))))..)))...))))).))))).....((((((((((.....))))........{.(((((...))))).,)))))).