Basic Information

Symbol
CCKAR
RNA class
mRNA
Alias
Cholecystokinin A Receptor CCK-AR CCK-1R CCK1R Cholecystokinin Type 1 Receptor Cholecystokinin Receptor Type A Cholecystokinin-1 Receptor CCK-A Receptor CCK1-R CCKRA Cholecystokinin Type-A Receptor CCK-A
Location (GRCh38)
4:26481396-26490484
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000730.3
Sequence length
1746.0 nt
GC content
0.5378

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-612.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -643.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 366.50
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000730.3 NCBI
ACUGCCUUUUCCACAACAGGAGUACAAAUGCUGGAGUGAGUGAGGUGAA… 1746 nt 0.5378
Summary

This gene encodes a G-protein coupled receptor that binds non-sulfated members of the cholecystokinin (CCK) family of peptide hormones. This receptor is a major physiologic mediator of pancreatic enzyme secretion and smooth muscle contraction of the gallbladder and stomach. In the central and peripheral nervous system this receptor regulates satiety and the release of beta-endorphin and dopamine. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that perinatal glyphosate exposure induced significant differential expression of lncRNAs and mRNAs in hippocampal tissue, with the CCKAR identified as a potential target in a ceRNA network involving lncRNA NR_033538 and miRNAs miR-142b and Let-7c, which is implicated in the neurotoxicity mechanism [Fan et al. DOI:10.1002/jdn.10102].