Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000730.3
Sequence Length
1746 nt
GC Content
0.5378
ACUGCCUUUUCCACAACAGGAGUACAAAUGCUGGAGUGAGUGAGGUGAACUCAAGUCGCCUUUAGGAAUGGCUGAAAAAGCCCACACCUGGAAAUCACUCCCUCCCUGCUCCUCCACGGCAGGUUGCAUCUGCGAGACGCUUCGGUCAUUAGAGGAAUGAGCCGGGAGUGAGCAAUUCACCAGCUCUCCAGCACUUGGUGGAAAGCAGCAGGCAAGGAUGGAUGUGGUUGACAGCCUUCUUGUGAAUGGAAGCAACAUCACUCCUCCCUGUGAACUCGGGCUCGAAAAUGAGACGCUUUUCUGCUUGGAUCAGCCCCGUCCUUCCAAAGAGUGGCAGCCAGCGGUGCAGAUUCUCUUGUACUCCUUGAUAUUCCUGCUCAGCGUGCUGGGAAACACGCUGGUCAUCACCGUGCUGAUUCGGAACAAGCGGAUGCGGACGGUCACCAACAUCUUCCUCCUCUCCCUGGCUGUCAGCGACCUCAUGCUCUGUCUCUUCUGCAUGCCGUUCAACCUCAUCCCCAAUCUGCUCAAGGAUUUCAUCUUCGGGAGCGCCGUUUGCAAGACCACCACCUACUUCAUGGGCACCUCUGUGAGUGUAUCUACCUUUAAUCUGGUAGCCAUAUCUCUAGAGAGAUAUGGUGCGAUUUGCAAACCCUUACAGUCCCGGGUCUGGCAGACAAAAUCCCAUGCUUUGAAGGUGAUUGCUGCUACCUGGUGCCUUUCCUUUACCAUCAUGACUCCGUACCCCAUUUAUAGCAACUUGGUGCCUUUUACCAAAAAUAACAACCAGACCGCGAAUAUGUGCCGCUUUCUACUGCCAAAUGAUGUUAUGCAGCAGUCCUGGCACACAUUCCUGUUACUCAUCCUCUUUCUUAUUCCUGGAAUUGUGAUGAUGGUGGCAUAUGGAUUAAUCUCUUUGGAACUCUACCAGGGAAUAAAAUUUGAGGCUAGCCAGAAGAAGUCUGCUAAAGAAAGGAAACCUAGCACCACCAGCAGCGGCAAAUAUGAGGACAGCGAUGGGUGUUACCUGCAAAAGACCAGGCCCCCGAGGAAGCUGGAGCUCCGGCAGCUGUCCACCGGCAGCAGCAGCAGGGCCAACCGCAUCCGGAGUAACAGCUCCGCAGCCAACCUGAUGGCCAAGAAAAGGGUGAUCCGCAUGCUCAUCGUCAUCGUGGUCCUCUUCUUCCUGUGCUGGAUGCCCAUCUUCAGCGCCAACGCCUGGCGGGCCUACGACACCGCCUCCGCAGAGCGCCGCCUCUCAGGAACCCCCAUUUCCUUCAUCCUCCUCCUGUCCUACACCUCCUCCUGCGUCAACCCCAUCAUCUACUGCUUCAUGAACAAACGCUUCCGCCUCGGCUUCAUGGCCACCUUCCCCUGCUGCCCCAAUCCUGGUCCCCCAGGGGCGAGGGGAGAGGUGGGGGAGGAGGAGGAAGGCGGGACCACAGGAGCCUCUCUGUCCAGGUUCUCGUACAGCCAUAUGAGUGCCUCGGUGCCACCCCAGUGAGAUGUCCCCUGACCCUCCACCGCAGAAGGAAGGCAGGGAGGAGGCAGAGAAGAAAGAACGGAAGAAGAGAUCAGGAAGAGAAGGAGCAGAGCUGAUGGAGAAGGAAGGCUCCAUCUCCAGUGGGAACUCUUCAAGGUCUGCUUUUCAUCCUUCAUCUGGAUUCCAGAGCACUGCUCCAGUGGGGCCAUGAUUGGUUUCUAGGCAGUUCAAAGCAGGAUAUGUUAAGUAACACUCACCAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-612.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -643.82
Frequency: 0.0000
Diversity: 366.50
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.................((((((((((.....((((.(((((((((((.......)))))((((((...((((.....))))....))))))..)))))).)))).(((((((((.((((..(((.(.((((...(((......)))..))))).)))..)))))))).))))).((((((((((....)))...)))))))((((((.((((.((((..(((((.(((..((...(((....)))))..))).)))))..)))).((((......))))(((......)))..))))..))))))(((((.((.((((.((.(((.....))).))...)))).)).)))))..))))))))))(((((((((((((.(((((((.(((...(((.((((((((((....((((.............((((((((..((((.........((((((.....(((((((..(((.((((((((.(.(((((.(((.....((((................(((((......)))))((((((((((((.....((((((.(((((.............((((.....(((((((.((..(((((........)))))(((((((((....)))))))))(((.....))).)).))))))).))))))))).))))))....)))).......))))))))..((((((...((((((.((((((((...........((((((..(((((.........((((((.....))))))............(((.(.((((.(((((((....((.((((..(((...)))..)))).))...))))))).))))).)))..((((((..((((........))))..).))))).)))))..))))))......(((((((.......)))))))..............((((.(((.....)))))))...))))))))....))))))..)))))))))).....)))))))).)))))).)))..)))....)).))))).....))))))(((((....))))).((((((....))))))........))))..))))))))(((((....))))).)))).....))))))))......)).))).)))))))))).....((.((.(((((.(((((((((.((((((((........))))))))........(((((..........)))))(((..((((......))))..)))...........((((..(((((((((..(((.....((((.((((((((.......(((((((((..............((....))...((((((.(((((.(((((((((.((.(((((..(((..((((((......).))))).)))))))).)).))).))))))..)).)))..)))))).....((((((((.((((((......)))))).)))).)).)).....)))).))))).....))))........)))).)))))))..)))))))))....)))).......)))))))))))))).)).))(((((((((((.((((((((((.(((....))).))))))...........)).)).)))))......)))))).(((((...)))))(.((((((.....(((((((....)))))))..)))))).)..))))))).))))))..................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{(((,{{((((((..{,{{,,,.,,..{(((((((.(((((((((((.,....,))))){(((((..,((((.....)))).,..)))))}..,}}})}.,,,,.(((((((((.((((..(((.(.((((...(((......)))..))))).)))..)))))))).)))))..}}}}|.|||}}}})))},})))))))))},.},))|,,.(((.(((((.((((((..{{{((({.......)))}))....((((........))))..,(((((..(((((.,......))))).)))))}.)))))).))))).)))...(((((((.....))(((((((......))))))).(((((((((((((((.(((((({.,{{...|||,|(((((((((..,,((((...,,,......|((((((((..((((.,......,((((((.....(((((((..(((.((((((((.(.(((((.(((.,,..((((................{((((......))))}((((((((((((.....((((((.(((((....,,.......{||{.....(((((((.((..(((((........)))))(((((((((....)))))))))(((,...,))).)).))))))).}}}}))))).))))))....)))).......))))))))..((((((...((((((.((((((((.{{.,{,,,,.((((((,,((({,.........((((((.....}))))}............{{{.(.((((.(((((((....((.((((..,{{...,,}..)))).))...))))))).))))).))}..{(((({..{(((........))))..).))))),))}))..)))))),,....(((((((.......)))))))........,,,,}.((({{(((.....)))))))...))))))))....))))))..))))))))))..,,.)))))))).)))))).)))..)))....)).))))).....))))))|{{(,.{{{|||||.(((({{...,))}))).,}}}}.,))))..))))))))(((((....))))),)))).....)))))))),.....||,|||,}}}||}}|||,....((.((.(((({{(((((((((.((((((((........))))))))........(((((,.........))))){{{,.{{{|,...,,)})}..||}........{{|{(((.,((((((((({.(((...,,((((.(((((,,..,{{{..,.......,...{{{{{{.....{(,.,,||,,,{|{|}}}}))||{{{{((((((.,{(((({....,(((....)))))))))))))))}))))))))),||}|||||.,||.{({((.{({((,,...,}}}}}({((((.((((((......)))))).)))).))...{{{..,.))).,..)}}}}}),.|}}}}}..})))).)))))))}}))))))))).,},))}),,.....)))))))))))))).)).)){{{{||||(((.(({{((((((.(((....))).)))))},,,|,..|,..,,.}).))))),...,,)))))}.(((((...))))){.((((((.....(((((((....)))))))..)))))).}..))))))).))))))))...)))))........
Back