Basic Information

Symbol
CCND3
RNA class
mRNA
Alias
Cyclin D3 G1/S-Specific Cyclin-D3 D3-Type Cyclin
Location (GRCh38)
6:41934934-42050357
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001760.5
Sequence length
2026.0 nt
GC content
0.5997

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-822.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -855.86 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 553.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001424058.1 NCBI
AAACACUUCGCCACUGCAGGGGUGGAGACUGGCUCUGUUCGGAUGCCGG… 1504 nt 0.5745
NM_001424059.1 NCBI
GUCAGGGAAGCGGCGCGCGCGCGCGGGCGGCGGGCGGGCUGGGGAUCCG… 1889 nt 0.5998
NM_001424060.1 NCBI
GUCAGGGAAGCGGCGCGCGCGCGCGGGCGGCGGGCGGGCUGGGGAUCCG… 1673 nt 0.5971
NM_001424061.1 NCBI
AAACACUUCGCCACUGCAGGGGUGGAGACUGGCUCUGUUCGGAUGCCGG… 1720 nt 0.5802
NM_001760.5 NCBI
GUCAGGGAAGCGGCGCGCGCGCGCGGGCGGCGGGCGGGCUGGGGAUCCG… 2026 nt 0.5997
Showing 11 to 15 of 15 entries
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the highly conserved cyclin family, whose members are characterized by a dramatic periodicity in protein abundance through the cell cycle. Cyclins function as regulators of CDK kinases. Different cyclins exhibit distinct expression and degradation patterns which contribute to the temporal coordination of each mitotic event. This cyclin forms a complex with and functions as a regulatory subunit of CDK4 or CDK6, whose activtiy is required for cell cycle G1/S transition. This protein has been shown to interact with and be involved in the phosphorylation of tumor suppressor protein Rb. The CDK4 activity associated with this cyclin was reported to be necessary for cell cycle progression through G2 phase into mitosis after UV radiation. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2008] CIViC Summary for CCND3 Gene Cyclin D has been shown in many cancer types to be misregulated. Well established for their oncogenic properties, the cyclins and the cyclin-dependent kinases (CDK's) they activate have been the focus of major research and development efforts over the past decade. The methods by which the cyclins are misregulated are widely variable, ranging from genomic amplification to changes in promoter methylation. Cyclin D3 loss has been reported in T-ALL, a seemingly unique trend when compared to the amplifcations and overexpressions of the other cyclin D's. In a mouse study, the targeted therapeutic palbociclib significantly increased the median survival of the cyclin D3 knockouts.

Forensic Context

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