Basic Information

Symbol
ACTG2
RNA class
mRNA
Alias
Actin Gamma 2, Smooth Muscle ACTSG ACTA3 ACTL3 Actin, Gamma 2, Smooth Muscle, Enteric Actin, Gamma-Enteric Smooth Muscle Alpha-Actin-3 Smooth Muscle Gamma-Actin Actin-Like Protein Gamma-2-Actin EC 3.6.4.- MMIHS5 VSCM1 ACTE VSCM ACT
Location (GRCh38)
2:73892232-73919865
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001615.4
Sequence length
1501.0 nt
GC content
0.5243

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-486.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -516.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 345.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001199893.2 NCBI
ACACCAGCCCUCAGUCACUGGGAGAAGAACCUCUCAUACCCUCGGUGCU… 1372 nt 0.5241
NM_001615.4 NCBI
ACACCAGCCCUCAGUCACUGGGAGAAGAACCUCUCAUACCCUCGGUGCU… 1501 nt 0.5243
Summary

Actins are highly conserved proteins that are involved in various types of cell motility and in the maintenance of the cytoskeleton. Three types of actins, alpha, beta and gamma, have been identified in vertebrates. Alpha actins are found in muscle tissues and are a major constituent of the contractile apparatus. The beta and gamma actins co-exist in most cell types as components of the cytoskeleton and as mediators of internal cell motility. This gene encodes actin gamma 2; a smooth muscle actin found in enteric tissues. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms. Based on similarity to peptide cleavage of related actins, the mature protein of this gene is formed by removal of two N-terminal peptides.[provided by RefSeq, Dec 2010]

Forensic Context

A study in human corpus cavernosum tissue identified the ACTG2 as a gene marker characterizing the EC4 subcluster, which is associated with endothelial-mesenchymal transition and is upregulated in this subcluster [Zhao et al. DOI:10.1038/s41467-022-31950-9]. In rat cardiac fibroblasts, RNA sequencing revealed the ACTG2 is downregulated in adult cells compared to younger groups, indicating its role as a cardiac development-associated gene whose expression decreases with developmental age [Perreault et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00074.2021].