Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001615.4
Sequence Length
1501 nt
GC Content
0.5243
ACACCAGCCCUCAGUCACUGGGAGAAGAACCUCUCAUACCCUCGGUGCUCCAGUCCCCAGCUCACUCAGCCACACACACCAUGUGUGAAGAGGAGACCACCGCGCUCGUGUGUGACAAUGGCUCUGGCCUGUGCAAGGCAGGCUUCGCAGGAGAUGAUGCCCCCCGGGCUGUCUUCCCCUCCAUUGUGGGCCGCCCUCGCCACCAGGGUGUGAUGGUGGGAAUGGGCCAGAAAGACAGCUAUGUGGGGGAUGAGGCUCAGAGCAAGCGAGGGAUCCUAACUCUCAAAUACCCCAUUGAACACGGCAUCAUCACCAACUGGGAUGACAUGGAGAAGAUCUGGCACCACUCCUUCUACAAUGAGCUGCGUGUAGCACCUGAAGAGCACCCCACCCUGCUCACAGAGGCUCCCCUAAAUCCCAAGGCCAACAGGGAAAAGAUGACCCAGAUCAUGUUUGAAACCUUCAAUGUCCCUGCCAUGUACGUCGCCAUUCAAGCUGUGCUCUCCCUCUAUGCCUCUGGCCGCACGACAGGCAUCGUCCUGGAUUCAGGUGAUGGCGUCACCCACAAUGUCCCCAUCUAUGAAGGCUAUGCCCUGCCCCAUGCCAUCAUGCGCCUGGACUUGGCUGGCCGUGACCUCACGGACUACCUCAUGAAGAUCCUCACAGAGAGAGGCUAUUCCUUUGUGACCACAGCUGAGAGAGAAAUUGUGCGAGACAUCAAGGAGAAGCUGUGCUAUGUGGCCCUGGAUUUUGAGAAUGAGAUGGCCACAGCAGCUUCCUCUUCCUCCCUGGAGAAGAGCUAUGAGCUGCCAGAUGGGCAGGUUAUCACCAUUGGCAAUGAGCGCUUCCGCUGCCCUGAGACCCUCUUCCAGCCUUCCUUUAUUGGCAUGGAGUCCGCUGGAAUUCAUGAGACAACCUACAAUUCCAUCAUGAAGUGUGACAUUGACAUCCGUAAGGACUUAUAUGCCAACAAUGUCCUCUCUGGGGGCACCACCAUGUACCCUGGCAUUGCUGACAGGAUGCAGAAGGAGAUCACAGCCCUGGCCCCCAGCACCAUGAAGAUCAAGAUUAUUGCUCCCCCAGAGCGGAAGUACUCAGUCUGGAUCGGGGGCUCUAUCCUGGCCUCUCUCUCCACCUUCCAGCAGAUGUGGAUCAGCAAGCCUGAGUAUGAUGAGGCAGGGCCCUCCAUUGUCCACAGGAAGUGCUUCUAAAGUCAGAACAGGUUCUCCAAGGAUCCCCUCGAGACUACUCUGUUACCAGUCAUGAAACAUUAAAACCUACAAGCCUUACUUCUCUGUGUGGGGCUCUUUUUUCCUGGGCUAUGUCUCAUACACAGUGCUAAGGACUUUUCACACAUUACUUUUAAUCCAUGCAAUAGUGCUGUAAGGUAGGUGCUAUCAUUAUACCCAUAUUACAGAUGAGGAAAUUGAGGCUCAGAGAAGUCAAGGACUUGCGAAGAUCACACAGAUUCCAGAUUAAAAUUCAAGUAUCUGACUGCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-486.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -516.38
Frequency: 0.0000
Diversity: 345.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((.((((((((.(((((((......))))....(((.(((((((((........(((.((((((((((((.....))))))..((((((.((..(((((....)))))(((((((....(((((((.....)))))))....(((.((.(((((((...)))).))).)).)))))))))).(((((.....(((((((((((((((((((....(((((.(((...((((....((((((...((.(((.(((((((...((((((.........((((........)))).((((((............((((((((((((((((...))).(((((((((..........))).)).))))(((..(((..(((((........))))).)))..)))..(((........)))....(((((((((.((((......)))).))).............)))))))))))).)))).))).....))))))...))))))..)).)))))))).)).(((.(.(((((.((((....))))))))).)))).)))))).))))............(((...)))))).))))))))))))))).)))))...)))))))))(((....))))).)).))))..........((((((((.(((....))))))))))).....)))))).)))......)).))).)))).))).((((((((....(((((((....(((((......))))))))))))))))))))((((((.((....))))))))..((((.(((((.....))))).))))..))).))))..)))).)))..(((.(.(((..(((.((((...(((((.......((((((((((((((..(((..(((((((.................)))))))((((.......)))))))...)))))).))))))))((((.((((((((((((((((((((..((((....(((((((((..(((.((.(((.((((....(((....(((((((.(..(((....(((..(((((.((((((.....)))))).))).))..))))))..)))))))).....)))..)))).))).)))))..)))))((((((((..(((.((((((.(((...(((((((.((((((((..........)))((((.(((.........(((((((((((..(((....))).))))..)).))))).........))).))))..........((((((((........))))))))..........))))).)))))))))).))).)))...).))..)).))))))...........))))....)))).....))).)))))..........)))......)))).))))).))))))))).))))..))).))).)..)))..((((.....)))).(((((............)))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
......{,..{(((,,{{((((((......))))),.......{{{{{{{{,,{,,...(((..,,.}}|({((({.....})))))..|||}}}.,},,,((((((.((((.((((((((....(((((((.....))))))),{.(((({{{{(((((((((({((((((((({(((......,.)))..(((({,.((((((........)))))),...))))..,,}))))))))..,}))))}.((.(((.(((((((.,.((((((.........{(({........}))}.((((((..,,,,.{{...,||||||((((((((,.{,{{{{(((((((((.{,....,}.))).)).))),(((..(((..(((((........))))).)))..)))..{({....,,..,}}....{{|||{..,.,,{,..}}}}))},.,||((,...,))},..}}}))})))))).)))}.)}}.....))))))...))))))..))}}))))))).)}.,.,.|}|||||}||||,,.,||}||||||{}|}|,.......}),}.}}}}}..}},{{{....((((((((......((((((((....((.(((,{((({(((((....))))).........,{{......}},.{(((((((((((.((((({((..((((((,(.....,,.,.))))).)..)))..)))))((((((((....(((((((.,..{(((,..,,,,,)},,)))))))))))))))(((((({({...,)}))))))..((((.(((((.....))))).)))).......((({...{(((....)))))))..(((.(((((.(((((.((.......((((((((((((((..((((.,((((({.,...............}}})))}||||..,,.,,)},))))...)))))).))))))))..,..(((.(((((((((..{(..,.((((.((((.({....}}.)))).))))...)).((((.{{,..((((...)))).....))..))))........,,..))))))))).))).,.....}).)))))..)))))))).....)))))))))))|((((..({.....)).)))),,))))))))).}.)))))))).))))))))}}})))))))))))).)}})))),{{,......,}{((((((((((..(((....))).))))..}).))))}..,,,,..,},..............{{(((((((({{{{{{,.,,|||,|{{...{{((((.(((..(((.......))).,))}.,}}|,,,,,},|||||,,.........,..,.,...)))((((((.{{.((((.{{....}})))).},.))))))...}))}}}..))),))})))))))).}})),)))).,..{(((.....}}}}...{{,......,,.,},,,))))}}),...
Back