Basic Information

Symbol
CCT7
RNA class
mRNA
Alias
Chaperonin Containing TCP1 Subunit 7 Nip7-1 Ccth Chaperonin Containing T-Complex Polypeptide 1 Subunit 7 T-Complex Protein 1 Subunit Eta TCP-1-Eta CCT-Eta Chaperonin Containing T-Complex Polypeptide 1, Eta Subunit Chaperonin Containing TCP1, Subunit 7 (Eta) HIV-1 Nef Interacting Protein HIV-1 Nef-Interacting Protein EC 3.6.1.- TCP1ETA CCTETA NIP7-1 CCTH
Location (GRCh38)
2:73233420-73253021
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006429.4
Sequence length
1847.0 nt
GC content
0.5160

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-661.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -699.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 511.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001009570.3 NCBI
AUUGUGGGUUGCUGGGCGGCCCGGUCUCGGAGAAGAGGGGAGAGUGGCG… 1235 nt 0.5231
NM_001166284.2 NCBI
AUUGUGGGUUGCUGGGCGGCCCGGUCUCGGAGAAGAGGGGAGAGUGGCG… 1586 nt 0.5202
NM_001166285.2 NCBI
AUUGUGGGUUGCUGGGCGGCCCGGUCUCGGAGAAGAGGGGAGAGUGGCG… 1943 nt 0.5142
NM_006429.4 NCBI
AUUGUGGGUUGCUGGGCGGCCCGGUCUCGGAGAAGAGGGGAGAGUGGCG… 1847 nt 0.5160
Summary

This gene encodes a molecular chaperone that is a member of the chaperonin containing TCP1 complex (CCT), also known as the TCP1 ring complex (TRiC). This complex consists of two identical stacked rings, each containing eight different proteins. Unfolded polypeptides enter the central cavity of the complex and are folded in an ATP-dependent manner. The complex folds various proteins, including actin and tubulin. Alternative splicing results in multiple transcript variants. Related pseudogenes have been identified on chromosomes 5 and 6. [provided by RefSeq, Oct 2009]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.