Basic Information

Symbol
CD177
RNA class
mRNA
Alias
CD177 Molecule PRV1 NB1 CD177 Antigen HNA2A Polycythemia Rubra Vera Protein 1 Human Neutrophil Alloantigen 2a NB1 Glycoprotein HNA-2a NB1 GP PRV-1 Polycythemia Rubra Vera 1 Cell Surface Receptor
Location (GRCh38)
19:43353686-43364395
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_020406.4
Sequence length
2195.0 nt
GC content
0.5599

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-815.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -857.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 553.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_020406.4 NCBI
AGAAAGAGAUUACCAGCCACAGACGGGUCAUGAGCGCGGUAUUACUGCU… 2195 nt 0.5599
Summary

This gene encodes a glycosyl-phosphatidylinositol (GPI)-linked cell surface glycoprotein that plays a role in neutrophil activation. The protein can bind platelet endothelial cell adhesion molecule-1 and function in neutrophil transmigration. Mutations in this gene are associated with myeloproliferative diseases. Over-expression of this gene has been found in patients with polycythemia rubra vera. Autoantibodies against the protein may result in pulmonary transfusion reactions, and it may be involved in Wegener's granulomatosis. A related pseudogene, which is adjacent to this gene on chromosome 19, has been identified. [provided by RefSeq, Apr 2014]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.