Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_020406.4

Sequence Length

2195 nt

GC Content

0.5599

AGAAAGAGAUUACCAGCCACAGACGGGUCAUGAGCGCGGUAUUACUGCUGGCCCUCCUGGGGUUCAUCCUCCCACUGCCAGGAGUGCAGGCGCUGCUCUGCCAGUUUGGGACAGUUCAGCAUGUGUGGAAGGUGUCCGACCUGCCCCGGCAAUGGACCCCUAAGAACACCAGCUGCGACAGCGGCUUGGGGUGCCAGGACACGUUGAUGCUCAUUGAGAGCGGACCCCAAGUGAGCCUGGUGCUCUCCAAGGGCUGCACGGAGGCCAAGGACCAGGAGCCCCGCGUCACUGAGCACCGGAUGGGCCCCGGCCUCUCCCUGAUCUCCUACACCUUCGUGUGCCGCCAGGAGGACUUCUGCAACAACCUCGUUAACUCCCUCCCGCUUUGGGCCCCACAGCCCCCAGCAGACCCAGGAUCCUUGAGGUGCCCAGUCUGCUUGUCUAUGGAAGGCUGUCUGGAGGGGACAACAGAAGAGAUCUGCCCCAAGGGGACCACACACUGUUAUGAUGGCCUCCUCAGGCUCAGGGGAGGAGGCAUCUUCUCCAAUCUGAGAGUCCAGGGAUGCAUGCCCCAGCCAGUUUGCAACCUGCUCAAUGGGACACAGGAAAUUGGGCCCGUGGGUAUGACUGAGAACUGCGAUAUGAAAGAUUUUCUGACCUGUCAUCGGGGGACCACCAUUAUGACACACGGAAACUUGGCUCAAGAACCCACUGAUUGGACCACAUCGAAUACCGAGAUGUGCGAGGUGGGGCAGGUGUGUCAGGAGACGCUGCUGCUCCUAGAUGUAGGACUCACAUCAACCCUGGUGGGGACAAAAGGCUGCAGCACUGUUGGGGCUCAAAAUUCCCAGAAGACCACCAUCCACUCAGCCCCUCCUGGGGUGCUUGUGGCCUCCUAUACCCACUUCUGCUCCUCGGACCUGUGCAAUAGUGCCAGCAGCAGCAGCGUUCUGCUGAACUCCCUCCCUCCUCAAGCUGCCCCUGUCCCAGGAGACCGGCAGUGUCCUACCUGUGUGCAGCCCCUUGGAACCUGUUCAAGUGGCUCCCCCCGAAUGACCUGCCCCAGGGGCGCCACUCAUUGUUAUGAUGGGUACAUUCAUCUCUCAGGAGGUGGGCUGUCCACCAAAAUGAGCAUUCAGGGCUGCGUGGCCCAACCUUCCAGCUUCUUGUUGAACCACACCAGACAAAUCGGGAUCUUCUCUGCGCGUGAGAAGCGUGAUGUGCAGCCUCCUGCCUCUCAGCAUGAGGGAGGUGGGGCUGAGGGCCUGGAGUCUCUCACUUGGGGGGUGGGGCUGGCACUGGCCCCAGCGCUGUGGUGGGGAGUGGUUUGCCCUUCCUGCUAACUCUAUUACCCCCACGAUUCUUCACCGCUGCUGACCACCCACACUCAACCUCCCUCUGACCUCAUAACCUAAUGGCCUUGGACACCAGAUUCUUUCCCAUUCUGUCCAUGAAUCAUCUUCCCCACACACAAUCAUUCAUAUCUACUCACCUAACAGCAACACUGGGGAGAGCCUGGAGCAUCCGGACUUGCCCUAUGGGAGAGGGGACGCUGGAGGAGUGGCUGCAUGUAUCUGAUAAUACAGACCCUGUCCUUUCUCCCAGUGCUGGGAUUUCUCCAUGUGAGGGGGCAGCAGGACACCCAGGGAUCUAGCGUGGGGGAGGAGAGGAGCCUAAUGAGAAAAUGACCAUCUAAAGCCUGCCCUUCAUUGGUCUGGUUCACGUCUCCAAACCAGCUUGGAUGGUAGCAGAGACUUCAGGGUGCUCCAGCCAAACGUAUUUGGGCAUCACCAUGACCUGGGAGGGGAAGAUGCACUGAGACGUAUGAGGCUUCCAGCCUAGCAGCCAGGGCCCUAGCACAAACAGGAGGCUCGCCCCAUCUGAGCAACUGCAGGAGAGGUUAGUACAGUCAUGCAUUGCUUAACGACAGGGACGUGUCGUUAGAAAUGUGUCGUUAGGUGAUUUUAUGACCAUAGGAACAUUGUAGCGUGCACUUACACCAACCCAGAUGGUACAGCCCAAUACACACCCAGGAUGGACGCUAGAGUCGACUGCUCCUAGGCUACAAGCCUGCAGUGCAUGUUAUGGUGUGAAUACUGCAGGCAAUCUUAACACCACGGCAAGUAUUUGUGCAUCUACACACAUCUAAACAUAGAAAAGGUACAGCAUAAAUACACUAUUGUCAUCUCAGCAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-815.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -857.14

Frequency: 0.0000

Diversity: 553.79

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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